More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0457 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0457  Cof-like hydrolase  100 
 
 
282 aa  578  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3274  Cof protein  47.01 
 
 
267 aa  246  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  47.97 
 
 
270 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  47.21 
 
 
270 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  47.37 
 
 
270 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  44.74 
 
 
267 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2352  Cof-like hydrolase  40.59 
 
 
292 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3771  Cof-like hydrolase  46.44 
 
 
273 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.540107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6319  putative Cof hydrolase  42.49 
 
 
270 aa  228  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171761  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  46.84 
 
 
272 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7133  Cof-like hydrolase  46.44 
 
 
266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3772  Cof-like hydrolase  43.61 
 
 
267 aa  215  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6359  Cof-like hydrolase  45.86 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.164075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3464  Cof-like hydrolase  44.36 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2353  Cof-like hydrolase  40.07 
 
 
273 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2813  Cof protein  39.78 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  38.95 
 
 
269 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  37.92 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  39.63 
 
 
269 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1274  Cof-like hydrolase  38.24 
 
 
272 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.59 
 
 
273 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  30.59 
 
 
273 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  30.59 
 
 
273 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  30.59 
 
 
273 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  30.59 
 
 
273 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  25.86 
 
 
266 aa  106  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.04 
 
 
273 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.83 
 
 
273 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  29.43 
 
 
267 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.08 
 
 
273 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  29.8 
 
 
273 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  29.37 
 
 
273 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  29.37 
 
 
273 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  27.01 
 
 
273 aa  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  28.88 
 
 
271 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0247  HAD superfamily hydrolase  29.08 
 
 
270 aa  99.4  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  30.08 
 
 
273 aa  98.6  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  29.52 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  27.94 
 
 
266 aa  96.3  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  27.44 
 
 
268 aa  95.9  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  27.44 
 
 
264 aa  95.5  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  26.88 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  28.42 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  27.21 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1509  HAD superfamily hydrolase  30.85 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  25.18 
 
 
273 aa  93.2  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1405  Cof-like hydrolase  27.7 
 
 
275 aa  92.8  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  29.81 
 
 
265 aa  92.8  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0848  phosphotransferase  28.62 
 
 
286 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0911  phosphotransferase  27.61 
 
 
286 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0820  phosphotransferase  27.61 
 
 
286 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0879  phosphotransferase  27.61 
 
 
286 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0934  phosphotransferase  27.61 
 
 
286 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.600795 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  24.81 
 
 
268 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  27.44 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  28.16 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  27.92 
 
 
271 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  29.09 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  28.89 
 
 
275 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  25.47 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  26.6 
 
 
270 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  28.11 
 
 
273 aa  89.7  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  27.86 
 
 
279 aa  89.7  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  26.6 
 
 
270 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  27.36 
 
 
277 aa  89.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0250  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.42 
 
 
290 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  25.36 
 
 
277 aa  89  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.09 
 
 
271 aa  89  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  29.09 
 
 
271 aa  89  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  23.55 
 
 
265 aa  89  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  26.16 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  26.16 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  27.21 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  27.84 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  26.16 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1811  Cof-like hydrolase  28.25 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  26.16 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  23.45 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  26.32 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  26.16 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  28.68 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  26.16 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  26.04 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  27.9 
 
 
272 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  28.37 
 
 
271 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1561  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  30.74 
 
 
278 aa  87  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.100499  normal  0.0550731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  27.68 
 
 
268 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  27.06 
 
 
268 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  29.29 
 
 
268 aa  86.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  27.41 
 
 
272 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.17 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  27.72 
 
 
268 aa  85.9  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  25 
 
 
277 aa  85.9  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  27.17 
 
 
281 aa  85.9  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  25.63 
 
 
460 aa  85.9  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  27.04 
 
 
272 aa  85.5  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0213  Cof-like hydrolase  25.75 
 
 
319 aa  85.5  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  26.42 
 
 
268 aa  85.5  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  27.41 
 
 
306 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>