More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7133 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7133  Cof-like hydrolase  100 
 
 		 266 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6359  Cof-like hydrolase  82.2 
 
 		 271 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.164075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  70.45 
 
 		 267 aa  353  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3772  Cof-like hydrolase  69.32 
 
 		 267 aa  333  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3464  Cof-like hydrolase  69.32 
 
 		 267 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3771  Cof-like hydrolase  64.5 
 
 		 273 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.540107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  53.88 
 
 		 272 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  53.88 
 
 		 270 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  52.47 
 
 		 270 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3274  Cof protein  50 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  50.95 
 
 		 270 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6319  putative Cof hydrolase  50.57 
 
 		 270 aa  248  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0457  Cof-like hydrolase  46.44 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2352  Cof-like hydrolase  45.42 
 
 		 292 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1274  Cof-like hydrolase  46.82 
 
 		 272 aa  222  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442966  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2353  Cof-like hydrolase  43.73 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  44.15 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2813  Cof protein  41.06 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  43.89 
 
 		 272 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  42.42 
 
 		 269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  29.01 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  31.5 
 
 		 270 aa  126  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  30.45 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  32.37 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  34.8 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  28.78 
 
 		 275 aa  122  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  33.33 
 
 		 271 aa  122  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  30.74 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  35.06 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.74 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.74 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  31 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.37 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  29.67 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  32.22 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  30.37 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  30.37 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  30.37 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  30.37 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  32.84 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.37 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  31.09 
 
 		 268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  31.02 
 
 		 273 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  29.78 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  30.6 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  32.26 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  31.25 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  31.25 
 
 		 269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  29.37 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  29.37 
 
 		 281 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  29.26 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  30.88 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  29.35 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  29.37 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  28.24 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  29.37 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  30.11 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  29.37 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  28.89 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  28.84 
 
 		 267 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  27.78 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 266 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  29 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  29 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  29 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1225  HAD superfamily hydrolase  26.02 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  29 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  29 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  29.2 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  28.08 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  29.71 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  28.52 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  25.75 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  30.4 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  29.08 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  26.79 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  26.79 
 
 		 273 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  28.25 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  26.43 
 
 		 273 aa  99  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  26.14 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  31.73 
 
 		 270 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  31.14 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  27.34 
 
 		 272 aa  97.8  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  29.59 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2876  Cof-like hydrolase  27.7 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0820  phosphotransferase  27.7 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  26.94 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  26.94 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  27.34 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  27.34 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2896  phosphotransferase  27.7 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0306419  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  23.02 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  26.98 
 
 		 306 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2879  phosphotransferase  29.64 
 
 		 273 aa  95.5  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  25.9 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  26.26 
 
 		 279 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  29.61 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  24.53 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>