More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2352 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2352  Cof-like hydrolase  100 
 
 
292 aa  590  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0457  Cof-like hydrolase  40.59 
 
 
282 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  40.98 
 
 
272 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3274  Cof protein  44.06 
 
 
267 aa  216  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6319  putative Cof hydrolase  43.07 
 
 
270 aa  215  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171761  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2353  Cof-like hydrolase  42.07 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  43.77 
 
 
270 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7133  Cof-like hydrolase  45.42 
 
 
266 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3771  Cof-like hydrolase  43.87 
 
 
273 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.540107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  40.84 
 
 
269 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  42.01 
 
 
270 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  42.69 
 
 
270 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2813  Cof protein  39.93 
 
 
278 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  41.7 
 
 
272 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  42.37 
 
 
267 aa  202  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3772  Cof-like hydrolase  42.75 
 
 
267 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6359  Cof-like hydrolase  43.13 
 
 
271 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.164075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1274  Cof-like hydrolase  42.05 
 
 
272 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  39.55 
 
 
269 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3464  Cof-like hydrolase  43.02 
 
 
267 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  31.09 
 
 
270 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  31.09 
 
 
270 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  31.09 
 
 
270 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  31.09 
 
 
270 aa  115  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  31.09 
 
 
270 aa  115  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  31.09 
 
 
270 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  31.09 
 
 
270 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  31.09 
 
 
270 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  30.71 
 
 
281 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  30.69 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  30.71 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  30.71 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  30.71 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  30.71 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  29.41 
 
 
271 aa  112  9e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  27.72 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  31.17 
 
 
273 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  32.62 
 
 
271 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  28.3 
 
 
268 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  28.09 
 
 
268 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  29.85 
 
 
269 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  27.74 
 
 
273 aa  106  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  29.14 
 
 
272 aa  106  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
273 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.57 
 
 
273 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
273 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
273 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
273 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1752  HAD family hydrolase  30.04 
 
 
271 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00695054  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  29.12 
 
 
271 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  26.62 
 
 
266 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  27.95 
 
 
273 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  29.21 
 
 
266 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  29.96 
 
 
270 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  30.04 
 
 
266 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  29.12 
 
 
271 aa  102  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.95 
 
 
273 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  27.64 
 
 
276 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.24 
 
 
273 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.84 
 
 
273 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  28.84 
 
 
268 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  22.81 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  28.74 
 
 
270 aa  99.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  24.73 
 
 
279 aa  99.4  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  27.34 
 
 
265 aa  99  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  26.48 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.48 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  26.48 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  26.48 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  29.58 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  30.08 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  24.36 
 
 
279 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  28.62 
 
 
268 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  32.71 
 
 
277 aa  97.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  29.23 
 
 
269 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  29.23 
 
 
269 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  26.18 
 
 
276 aa  96.7  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  26.98 
 
 
273 aa  96.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  24.65 
 
 
284 aa  96.3  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  26.13 
 
 
283 aa  96.7  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1405  Cof-like hydrolase  28.32 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  26.13 
 
 
283 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2702  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.69 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  28.57 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  28.52 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  29.06 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2666  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.26 
 
 
283 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.968723  normal  0.0125888 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0457  Cof-like hydrolase  26.15 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  28.46 
 
 
272 aa  93.6  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.13 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  28.1 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  31.6 
 
 
269 aa  93.2  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  26.32 
 
 
278 aa  92.8  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0138  Cof-like hydrolase  26.71 
 
 
279 aa  92.8  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0213598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  28.52 
 
 
272 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  28.52 
 
 
272 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0205  HAD superfamily hydrolase  27.87 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.855458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0253  HAD superfamily hydrolase  26.53 
 
 
290 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0213  Cof-like hydrolase  25.08 
 
 
319 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0247  HAD superfamily hydrolase  23.6 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>