More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2588 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  100 
 
 		 269 aa  541  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  65.3 
 
 		 269 aa  332  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  62.13 
 
 		 272 aa  323  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2353  Cof-like hydrolase  43.23 
 
 		 273 aa  205  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2352  Cof-like hydrolase  40.67 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6319  putative Cof hydrolase  41.7 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0457  Cof-like hydrolase  39.63 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7133  Cof-like hydrolase  43.56 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  40.61 
 
 		 270 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3771  Cof-like hydrolase  41.89 
 
 		 273 aa  185  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.540107 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1274  Cof-like hydrolase  39.03 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442966  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  41.06 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  39 
 
 		 272 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  39.38 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6359  Cof-like hydrolase  42.97 
 
 		 271 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.164075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  39.25 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3772  Cof-like hydrolase  41.44 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3274  Cof protein  38.26 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3464  Cof-like hydrolase  41.44 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2813  Cof protein  34.96 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  32.16 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  32.6 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.55 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  32.55 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.16 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  32.55 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  32.55 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  32.55 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.28 
 
 		 273 aa  125  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.87 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  31.89 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  31.5 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0214  HAD superfamily hydrolase  30.93 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0250  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.93 
 
 		 290 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  33.21 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.14 
 
 		 290 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  33.58 
 
 		 266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0246  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.93 
 
 		 290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.24 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  28.99 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  32.59 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  28.99 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0253  HAD superfamily hydrolase  30.58 
 
 		 290 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0210  HAD superfamily hydrolase  30.24 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1845  HAD superfamily hydrolase  30.88 
 
 		 269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0213  Cof-like hydrolase  30.24 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  29.81 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  29.82 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0247  HAD superfamily hydrolase  29.21 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  29.01 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  32.27 
 
 		 270 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  32.27 
 
 		 270 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  29.04 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  31.35 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  30.45 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0224  Cof-like hydrolase  27 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  31.65 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  27.86 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  30.57 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4042  Cof-like hydrolase  32.97 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  28.95 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  31.22 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  31.62 
 
 		 269 aa  105  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  27.14 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  30.88 
 
 		 272 aa  105  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  31.29 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4000  Cof-like hydrolase  32.23 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  30.94 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  31.25 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  30.94 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  30 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  31.25 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  30.07 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  27.04 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  31.2 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  25.19 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  30.42 
 
 		 266 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  30.22 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  30.42 
 
 		 266 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  31.56 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  30.42 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.152006 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  30.42 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1225  HAD superfamily hydrolase  30.04 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  30.74 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  30.83 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  30.83 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  30.04 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  30.04 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  30.04 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  27.51 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  27.51 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  27.57 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  30.66 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  28.41 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  30.66 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  30.51 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  26.49 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  28.01 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  26.24 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  31.29 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>