More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0258 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  549  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  45.79 
 
 
268 aa  226  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  43.89 
 
 
268 aa  208  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  44.91 
 
 
268 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  38.64 
 
 
278 aa  198  9e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  41.51 
 
 
269 aa  193  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  40.38 
 
 
272 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  37.79 
 
 
267 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  38.58 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  37.45 
 
 
271 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0607  Cof-like hydrolase  37.73 
 
 
271 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000496024  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4000  Cof-like hydrolase  34.8 
 
 
271 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4042  Cof-like hydrolase  34.43 
 
 
271 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  41.33 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0138  Cof-like hydrolase  34.07 
 
 
279 aa  162  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0213598  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  36.88 
 
 
266 aa  159  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1752  HAD family hydrolase  35.19 
 
 
271 aa  158  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00695054  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  35.99 
 
 
279 aa  158  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  35.99 
 
 
279 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1119  Cof-like hydrolase  38.26 
 
 
271 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.78603  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3223  Cof-like hydrolase  31.14 
 
 
273 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  34.88 
 
 
271 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  34.29 
 
 
273 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  34.29 
 
 
273 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  34.29 
 
 
273 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  34.29 
 
 
273 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.29 
 
 
273 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  36.17 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.29 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  34.29 
 
 
273 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  32.6 
 
 
273 aa  145  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  33.73 
 
 
273 aa  145  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.16 
 
 
273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.16 
 
 
273 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  34.16 
 
 
273 aa  145  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  35.89 
 
 
271 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  36.86 
 
 
266 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  36.5 
 
 
266 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  33.95 
 
 
279 aa  142  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  34.27 
 
 
274 aa  142  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.6 
 
 
271 aa  139  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  35.04 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  32.35 
 
 
267 aa  139  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  32.35 
 
 
267 aa  139  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1451  Cof-like hydrolase  30.77 
 
 
276 aa  138  7e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  30.67 
 
 
276 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  34.67 
 
 
269 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  32.85 
 
 
274 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  35.11 
 
 
264 aa  136  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  34.31 
 
 
269 aa  135  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  30.33 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  31.86 
 
 
270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  31.53 
 
 
270 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  31.53 
 
 
270 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  33.33 
 
 
272 aa  132  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  32.1 
 
 
269 aa  132  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  33.46 
 
 
268 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  29.59 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  31.53 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  31.53 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  31.53 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  31.53 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  31.53 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  32.99 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  32.88 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  33.45 
 
 
281 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  32.88 
 
 
281 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  31.25 
 
 
270 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  32.99 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  30.82 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  32.75 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  32.23 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  29.67 
 
 
273 aa  126  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  31.9 
 
 
268 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  30.27 
 
 
273 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.37 
 
 
271 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  30.82 
 
 
273 aa  123  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  30.11 
 
 
277 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  32.12 
 
 
267 aa  123  4e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  31.19 
 
 
270 aa  122  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  32.01 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  27.51 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  30.25 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  31.34 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  29.37 
 
 
268 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30 
 
 
269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0457  Cof-like hydrolase  31.78 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  29.82 
 
 
283 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  29.82 
 
 
268 aa  119  6e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  29.54 
 
 
285 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30 
 
 
269 aa  118  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  29.63 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  29.63 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  29.63 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.63 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  29.63 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  29.63 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0704  HAD family hydrolase  32.26 
 
 
290 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  30.48 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.63 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>