More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03654 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  100 
 
 
266 aa  554  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  554  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  98.87 
 
 
266 aa  550  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  99.25 
 
 
266 aa  551  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  99.62 
 
 
266 aa  553  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.152006 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  99.25 
 
 
266 aa  551  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  99.25 
 
 
266 aa  551  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  98.87 
 
 
266 aa  550  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  99.25 
 
 
266 aa  551  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  87.92 
 
 
266 aa  501  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  78.49 
 
 
266 aa  447  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  77.36 
 
 
266 aa  443  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  77.74 
 
 
266 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  74.72 
 
 
265 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  74.34 
 
 
269 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  74.34 
 
 
269 aa  421  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  74.34 
 
 
269 aa  421  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  74.44 
 
 
266 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  51.72 
 
 
274 aa  282  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  49.81 
 
 
275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  49.04 
 
 
270 aa  261  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  47.92 
 
 
265 aa  261  8e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  47.19 
 
 
266 aa  255  6e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  39.02 
 
 
272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2727  Cof-like hydrolase  41.86 
 
 
281 aa  203  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  41.04 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  40.23 
 
 
277 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  40.23 
 
 
291 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  39.85 
 
 
274 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  39.85 
 
 
274 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  39.85 
 
 
274 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  39.85 
 
 
274 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  41.6 
 
 
274 aa  192  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  38.72 
 
 
273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  38.72 
 
 
280 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  39.1 
 
 
273 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  38.72 
 
 
273 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  38.72 
 
 
273 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  38.72 
 
 
273 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  38.72 
 
 
273 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  38.72 
 
 
273 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  37.22 
 
 
273 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  37.59 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  38.81 
 
 
291 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  38.85 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  38.85 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  38.85 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  38.85 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0534  hydrolase Cof  38.46 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  38.85 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  38.85 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  38.85 
 
 
272 aa  178  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3291  Cof-like hydrolase  36.47 
 
 
263 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  37.31 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  37.31 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  37.31 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  37.31 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  37.31 
 
 
272 aa  172  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  36.92 
 
 
272 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3044  HAD family hydrolase  36.88 
 
 
273 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3083  HAD family hydrolase  36.5 
 
 
273 aa  168  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3225  Cof-like hydrolase  36.5 
 
 
273 aa  168  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  37.04 
 
 
265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3169  Cof-like hydrolase  37.66 
 
 
255 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103959  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  33.96 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0156  Cof-like hydrolase  34.69 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0069  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.98 
 
 
293 aa  129  3e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.707164  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0427  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.08 
 
 
279 aa  119  7e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.635472  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  30.04 
 
 
265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  28.87 
 
 
262 aa  109  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  28.4 
 
 
262 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  30.07 
 
 
276 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  27.97 
 
 
269 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  30.26 
 
 
267 aa  98.6  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  30.42 
 
 
269 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  30.37 
 
 
265 aa  96.7  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  28.67 
 
 
276 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  29.18 
 
 
275 aa  96.7  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  27.7 
 
 
274 aa  96.3  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  29.6 
 
 
267 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  27.02 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  29.52 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  27.94 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  28.21 
 
 
273 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  29.22 
 
 
266 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  26.97 
 
 
268 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.08 
 
 
273 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0374  HAD superfamily hydrolase  29.52 
 
 
270 aa  92.4  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0519666  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0607  Cof-like hydrolase  30.66 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000496024  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.08 
 
 
273 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  28.47 
 
 
272 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.08 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  29.35 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  28.39 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  28.09 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  28.08 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  29.21 
 
 
272 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  27.76 
 
 
257 aa  88.6  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  27.76 
 
 
257 aa  88.6  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.76 
 
 
257 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>