More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2386 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  72.46 
 
 		 274 aa  422  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  71.74 
 
 		 270 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  67.05 
 
 		 265 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  54.14 
 
 		 266 aa  298  5e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  52.85 
 
 		 266 aa  287  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  52.47 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  51.71 
 
 		 266 aa  284  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  52.09 
 
 		 269 aa  281  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  52.09 
 
 		 269 aa  281  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  52.09 
 
 		 269 aa  281  7.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  51.13 
 
 		 265 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  50.19 
 
 		 266 aa  276  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  50.19 
 
 		 266 aa  276  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  50.19 
 
 		 266 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  50.19 
 
 		 266 aa  276  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  50.19 
 
 		 266 aa  276  4e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  53.23 
 
 		 266 aa  275  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  49.81 
 
 		 266 aa  275  8e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  49.81 
 
 		 266 aa  274  9e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.152006 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  49.81 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  49.81 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  48.67 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  40.75 
 
 		 273 aa  215  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  41.51 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  42.42 
 
 		 273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  42.05 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  40.75 
 
 		 273 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  41.67 
 
 		 291 aa  211  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  42.05 
 
 		 273 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  42.05 
 
 		 280 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  42.05 
 
 		 273 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  42.05 
 
 		 273 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  42.05 
 
 		 273 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  42.05 
 
 		 273 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  41.67 
 
 		 274 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  41.67 
 
 		 274 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  41.67 
 
 		 274 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  40.53 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  40.91 
 
 		 277 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  41.06 
 
 		 291 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  40.3 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2727  Cof-like hydrolase  38.87 
 
 		 281 aa  199  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3044  HAD family hydrolase  38.49 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3083  HAD family hydrolase  38.11 
 
 		 273 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3225  Cof-like hydrolase  38.11 
 
 		 273 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3291  Cof-like hydrolase  38.49 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0534  hydrolase Cof  36.92 
 
 		 272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  38.02 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  36.92 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  36.92 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  36.92 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  36.92 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  36.92 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  36.92 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  36.92 
 
 		 272 aa  182  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  36.7 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  36.88 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  36.88 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  36.88 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  36.88 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  36.5 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  36.5 
 
 		 272 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  34.36 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3169  Cof-like hydrolase  36.02 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0069  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.51 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.707164  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0156  Cof-like hydrolase  31.09 
 
 		 269 aa  127  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  30.43 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  29.1 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  26.89 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  26.89 
 
 		 262 aa  109  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0427  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.39 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.635472  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  30.04 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0879  phosphotransferase  29.64 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0848  phosphotransferase  29.64 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0820  phosphotransferase  29.64 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0911  phosphotransferase  29.37 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0934  phosphotransferase  29.64 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.600795 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  28.93 
 
 		 272 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  25.93 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  30.08 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  29.96 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  29.59 
 
 		 268 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  27.47 
 
 		 275 aa  98.6  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  27.89 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  28.16 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  28.16 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  29.86 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  27.82 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  28.36 
 
 		 268 aa  94  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  25.87 
 
 		 306 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2876  Cof-like hydrolase  26.13 
 
 		 272 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0820  phosphotransferase  26.13 
 
 		 272 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2896  phosphotransferase  26.13 
 
 		 272 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0306419  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  25.87 
 
 		 272 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  25.26 
 
 		 279 aa  92.4  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  27.54 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  25.87 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  25.17 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>