More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0789 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  100 
 
 
272 aa  568  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  98.53 
 
 
272 aa  564  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  98.9 
 
 
306 aa  565  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  99.26 
 
 
272 aa  565  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2876  Cof-like hydrolase  98.9 
 
 
272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0820  phosphotransferase  98.9 
 
 
272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2896  phosphotransferase  98.9 
 
 
272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0306419  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0820  phosphotransferase  83.46 
 
 
286 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0934  phosphotransferase  83.09 
 
 
286 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.600795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0879  phosphotransferase  83.46 
 
 
286 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0911  phosphotransferase  83.46 
 
 
286 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0848  phosphotransferase  82.72 
 
 
286 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  78.31 
 
 
272 aa  464  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  63.6 
 
 
273 aa  381  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  63.24 
 
 
273 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  63.6 
 
 
273 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1306  phosphotransferase  62.87 
 
 
274 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  59.93 
 
 
273 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  59.56 
 
 
273 aa  347  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1180  phosphotransferase  58.82 
 
 
273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2879  phosphotransferase  59.93 
 
 
273 aa  330  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  42.91 
 
 
273 aa  223  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0120  Cof-like hydrolase  41.89 
 
 
274 aa  199  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0986  hypothetical protein  40.44 
 
 
273 aa  195  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  38.2 
 
 
244 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  37.83 
 
 
244 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  37.45 
 
 
244 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  25.93 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  26.49 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  29.7 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  26.94 
 
 
267 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  26.79 
 
 
276 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  26.43 
 
 
276 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  25.18 
 
 
277 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  28.68 
 
 
268 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  27.04 
 
 
279 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  30.82 
 
 
268 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  27.86 
 
 
274 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  24.82 
 
 
277 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  29.15 
 
 
272 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2702  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.87 
 
 
283 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  29.09 
 
 
268 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  24.48 
 
 
279 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  24.83 
 
 
279 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  29.39 
 
 
274 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 
284 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  30.15 
 
 
285 aa  99.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  27.08 
 
 
283 aa  99.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.08 
 
 
283 aa  99  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  27.08 
 
 
283 aa  98.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.08 
 
 
283 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  27.08 
 
 
283 aa  98.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  27.08 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2666  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.39 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.968723  normal  0.0125888 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  26.67 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  28.42 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  29.46 
 
 
271 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  26.83 
 
 
283 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  26.4 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  24.19 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2434  Cof protein  27.55 
 
 
282 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  26.28 
 
 
268 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  30.23 
 
 
260 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  25 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 
278 aa  93.6  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2352  Cof-like hydrolase  28.52 
 
 
292 aa  92.4  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  26.1 
 
 
266 aa  92.4  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  25.87 
 
 
275 aa  92.4  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  30.82 
 
 
281 aa  92  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  28.36 
 
 
269 aa  92  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  26.26 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  30.34 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  27.01 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1298  HAD superfamily hydrolase  24.29 
 
 
286 aa  91.3  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000863241  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  29.03 
 
 
265 aa  89.7  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  26.88 
 
 
270 aa  89.4  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  27.31 
 
 
257 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2677  Cof-like hydrolase  28.96 
 
 
257 aa  89.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00196441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6319  putative Cof hydrolase  28.62 
 
 
270 aa  89.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171761  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  27.99 
 
 
257 aa  89.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7133  Cof-like hydrolase  26.09 
 
 
266 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2353  Cof-like hydrolase  29.07 
 
 
273 aa  89  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  26.35 
 
 
280 aa  89  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  27.38 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.68 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  26.79 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  28.97 
 
 
272 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.24 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  27.24 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  26.94 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  26.94 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  26.94 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  25.74 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1489  Cof-like hydrolase  30.47 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.94 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  28.07 
 
 
266 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  26.1 
 
 
266 aa  87  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.94 
 
 
257 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  28.07 
 
 
266 aa  87  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.152006 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  27.72 
 
 
266 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>