More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2932 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  548  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  66.54 
 
 		 274 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  67.05 
 
 		 275 aa  365  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  64.26 
 
 		 270 aa  352  5e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  55.43 
 
 		 266 aa  307  9e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  48.87 
 
 		 266 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  49.43 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  49.25 
 
 		 266 aa  269  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  49.06 
 
 		 266 aa  268  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  48.12 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  48.12 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  48.12 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  48.12 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  48.12 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  49.06 
 
 		 266 aa  262  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  47.74 
 
 		 266 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  47.92 
 
 		 266 aa  261  6e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.152006 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  47.92 
 
 		 266 aa  261  8e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  47.92 
 
 		 266 aa  261  8e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  47.55 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  47.55 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  47.17 
 
 		 269 aa  258  8e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  46.24 
 
 		 266 aa  249  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  40.61 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0534  hydrolase Cof  38.64 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  38.64 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  38.64 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  38.64 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  38.64 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  38.64 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  38.64 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  38.64 
 
 		 272 aa  198  9e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  36.98 
 
 		 274 aa  192  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  37.45 
 
 		 273 aa  191  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  37.08 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  37.22 
 
 		 274 aa  188  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  37.83 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  37.59 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  37.59 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  37.45 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  36.84 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  36.84 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  36.84 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3044  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 273 aa  185  8e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  36.7 
 
 		 272 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  37.22 
 
 		 273 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  37.22 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  37.22 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  37.22 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  37.22 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  37.22 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  37.22 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  36.33 
 
 		 272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  36.33 
 
 		 272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  36.33 
 
 		 272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  36.09 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2727  Cof-like hydrolase  35.61 
 
 		 281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3083  HAD family hydrolase  37.12 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3225  Cof-like hydrolase  37.12 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  36.84 
 
 		 291 aa  182  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  35.96 
 
 		 272 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3169  Cof-like hydrolase  37.76 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  36.9 
 
 		 265 aa  174  9e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3291  Cof-like hydrolase  37.5 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  32.57 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0069  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.89 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.707164  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0156  Cof-like hydrolase  30.07 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  29.41 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  27.68 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  30.13 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0427  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.54 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.635472  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  30.6 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  29.81 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  27.71 
 
 		 265 aa  102  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  26.79 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  27.88 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  26.67 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  26.77 
 
 		 269 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  27.08 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  28.36 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  28 
 
 		 272 aa  92.8  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0457  Cof-like hydrolase  29.17 
 
 		 270 aa  92.8  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  29.92 
 
 		 275 aa  92  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0795  Cof-like hydrolase  28.68 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  27.94 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  25.82 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  28.1 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  27.06 
 
 		 273 aa  89  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.06 
 
 		 273 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  31.17 
 
 		 271 aa  89.4  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.06 
 
 		 273 aa  89  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  28.3 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  25.73 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  25.64 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0762  Cof-like hydrolase  28.24 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.67 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  27.87 
 
 		 268 aa  85.9  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.67 
 
 		 273 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  26.67 
 
 		 273 aa  85.9  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1274  Cof-like hydrolase  25.82 
 
 		 272 aa  85.9  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>