More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1228 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  100 
 
 
266 aa  536  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  44.7 
 
 
273 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  44.87 
 
 
273 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  44.87 
 
 
273 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  44.87 
 
 
273 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  44.87 
 
 
273 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  44.87 
 
 
273 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  46.42 
 
 
291 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  44.87 
 
 
280 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  44.87 
 
 
273 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  43.94 
 
 
274 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  43.94 
 
 
274 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  43.94 
 
 
274 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  43.56 
 
 
274 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  41.89 
 
 
273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  44.32 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  42.26 
 
 
273 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  44.15 
 
 
273 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  44.32 
 
 
291 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  35.36 
 
 
272 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  34.1 
 
 
274 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  34.36 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  34.73 
 
 
266 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  33.97 
 
 
269 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  33.97 
 
 
269 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  33.59 
 
 
266 aa  158  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  33.59 
 
 
269 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  32.57 
 
 
265 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  32.82 
 
 
266 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  34.34 
 
 
265 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  32.57 
 
 
270 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  33.96 
 
 
266 aa  152  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  33.96 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.152006 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  33.96 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  33.96 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  33.96 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  33.96 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  33.96 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  33.96 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  33.96 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  33.96 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3044  HAD family hydrolase  31.54 
 
 
273 aa  145  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  32.57 
 
 
274 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3083  HAD family hydrolase  31.15 
 
 
273 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3225  Cof-like hydrolase  31.15 
 
 
273 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  33.21 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  32.26 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  32.26 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  32.26 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  32.26 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  32.26 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  32.26 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  32.26 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0534  hydrolase Cof  31.85 
 
 
272 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  30.08 
 
 
266 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  32.37 
 
 
272 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  31.05 
 
 
272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  32.37 
 
 
272 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3291  Cof-like hydrolase  26.74 
 
 
263 aa  132  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  31.95 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  31.95 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  31.12 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3169  Cof-like hydrolase  31.03 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103959  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2727  Cof-like hydrolase  28.06 
 
 
281 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  27.17 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  27.82 
 
 
265 aa  112  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  27.69 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  24.51 
 
 
262 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  26.79 
 
 
265 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  28.76 
 
 
268 aa  99.4  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4133  HAD family hydrolase  26.12 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0427  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.68 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.635472  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  27.34 
 
 
267 aa  96.3  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3893  Cof-like hydrolase  28 
 
 
261 aa  95.9  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.805334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3804  HAD-superfamily hydrolase  28 
 
 
261 aa  95.9  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  28.94 
 
 
274 aa  95.9  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  28.45 
 
 
264 aa  95.5  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28 
 
 
267 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119194 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1066  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.21 
 
 
267 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.840959  normal  0.475939 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0156  Cof-like hydrolase  26.42 
 
 
269 aa  95.1  9e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3974  HAD family hydrolase  28 
 
 
261 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3819  HAD-superfamily hydrolase  25.71 
 
 
261 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4285  HAD family hydrolase  28 
 
 
261 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  26.24 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.71 
 
 
267 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0996454  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4172  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.49 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0575456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  27.8 
 
 
273 aa  92.4  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  26.15 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  25.84 
 
 
268 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2762  Cof-like hydrolase  26.56 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  24.46 
 
 
274 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  28 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  28.36 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  24.72 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  26.94 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  29.8 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0217  Cof-like hydrolase  25.57 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  27.17 
 
 
262 aa  89  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  25.27 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  25.27 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>