More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3169 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3169  Cof-like hydrolase  100 
 
 		 255 aa  529  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103959  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  100 
 
 		 272 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  100 
 
 		 272 aa  518  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  100 
 
 		 272 aa  518  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  100 
 
 		 272 aa  518  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  100 
 
 		 272 aa  518  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  99.6 
 
 		 272 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0534  hydrolase Cof  99.2 
 
 		 272 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  80.4 
 
 		 272 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  80.4 
 
 		 272 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  80.4 
 
 		 272 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  79.6 
 
 		 272 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  80 
 
 		 272 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  78 
 
 		 272 aa  415  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  55.56 
 
 		 274 aa  300  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3044  HAD family hydrolase  56.22 
 
 		 273 aa  288  8e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3225  Cof-like hydrolase  55.82 
 
 		 273 aa  285  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3083  HAD family hydrolase  55.82 
 
 		 273 aa  285  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  37.76 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  40.59 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  40.59 
 
 		 269 aa  175  8e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  40.59 
 
 		 269 aa  175  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  38.91 
 
 		 265 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  34.55 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  37.66 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  39.83 
 
 		 266 aa  161  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  36.67 
 
 		 273 aa  161  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  36.02 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  37.66 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  36.02 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  37.66 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  37.66 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  37.66 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  37.66 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  37.66 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.152006 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  37.66 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  37.66 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  37.66 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  36.25 
 
 		 273 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  37.08 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  37.5 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  35.42 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  36.25 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  36.25 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  36.25 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  36.25 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  36.25 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  36.25 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  36.63 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  32.5 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  35.83 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  36.25 
 
 		 277 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  36.25 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  32.92 
 
 		 273 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  34.17 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  34.17 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  34.17 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  35.56 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  34.75 
 
 		 270 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3291  Cof-like hydrolase  30.83 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  31.09 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  29.05 
 
 		 265 aa  132  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2727  Cof-like hydrolase  31.78 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  31.03 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0427  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.15 
 
 		 279 aa  99  6e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.635472  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  24.59 
 
 		 262 aa  86.3  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0069  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.76 
 
 		 293 aa  85.5  8e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.707164  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0156  Cof-like hydrolase  25.74 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  28.12 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  26.46 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  29.41 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2353  Cof-like hydrolase  26.79 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  27.95 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  27.95 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1119  Cof-like hydrolase  29.41 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.78603  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3274  Cof protein  24.55 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  28.38 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  28.63 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  27.95 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  26.2 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  26.2 
 
 		 272 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  24.41 
 
 		 269 aa  72  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  26.2 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  23.26 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  26.79 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  25.83 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  26.13 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0820  phosphotransferase  26.49 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2876  Cof-like hydrolase  26.49 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104065  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  27.95 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  26.75 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2896  phosphotransferase  26.49 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0306419  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  24.69 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1077  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.89 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000777546  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4119  HAD superfamily hydrolase  23.17 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  26.59 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  26.7 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  25.78 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4161  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.71 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000350471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>