More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2983 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  100 
 
 
273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  79.49 
 
 
273 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  78.75 
 
 
273 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  76.01 
 
 
291 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  74.26 
 
 
273 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  74.26 
 
 
273 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  74.63 
 
 
273 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  74.26 
 
 
273 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  74.26 
 
 
280 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  74.26 
 
 
273 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  73.63 
 
 
274 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  73.63 
 
 
274 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  73.63 
 
 
274 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  74.26 
 
 
273 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  73.26 
 
 
274 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  73.61 
 
 
273 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  72.32 
 
 
277 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  72.32 
 
 
291 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  44.7 
 
 
266 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  41.51 
 
 
275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  40.22 
 
 
272 aa  206  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  40.67 
 
 
269 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  40.67 
 
 
269 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  40.67 
 
 
269 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  40.3 
 
 
274 aa  202  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  39.93 
 
 
266 aa  202  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  41.04 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  41.04 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  41.04 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.152006 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  41.04 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  40.67 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  40.67 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  40.67 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  40.67 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  40.67 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  41.04 
 
 
265 aa  198  9e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  41.04 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  41.04 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  39.18 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  38.4 
 
 
270 aa  188  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  40.67 
 
 
266 aa  188  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  37.45 
 
 
265 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  38.2 
 
 
266 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  36.78 
 
 
272 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  36.78 
 
 
272 aa  175  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  36.78 
 
 
272 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  36.78 
 
 
272 aa  175  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  36.78 
 
 
272 aa  175  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  36.78 
 
 
272 aa  175  8e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  36.78 
 
 
272 aa  175  9e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0534  hydrolase Cof  36.4 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  36.5 
 
 
274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3291  Cof-like hydrolase  37.21 
 
 
263 aa  168  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  35.63 
 
 
272 aa  168  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3044  HAD family hydrolase  34.21 
 
 
273 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3225  Cof-like hydrolase  35.21 
 
 
273 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3083  HAD family hydrolase  35.21 
 
 
273 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3169  Cof-like hydrolase  36.67 
 
 
255 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103959  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  34.1 
 
 
272 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  33.72 
 
 
272 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  33.72 
 
 
272 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  33.72 
 
 
272 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2727  Cof-like hydrolase  34.93 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  33.33 
 
 
272 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  30.86 
 
 
265 aa  142  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0156  Cof-like hydrolase  29.37 
 
 
269 aa  125  7e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  29.48 
 
 
262 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0427  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.45 
 
 
279 aa  120  3e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.635472  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1451  Cof-like hydrolase  31.02 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  27.84 
 
 
265 aa  112  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  26.87 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  28.84 
 
 
268 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  28.14 
 
 
262 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  30.86 
 
 
268 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  29.85 
 
 
267 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  30.6 
 
 
268 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  27.17 
 
 
274 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  31.11 
 
 
269 aa  103  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4036  Cof protein  29.78 
 
 
284 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0069  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.77 
 
 
293 aa  99  8e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.707164  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  28.21 
 
 
273 aa  98.6  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  28.41 
 
 
268 aa  97.8  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  27.68 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  27.88 
 
 
265 aa  95.5  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0457  Cof-like hydrolase  29.7 
 
 
270 aa  95.1  9e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  29.04 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  26.28 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  26.59 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  29.29 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  28.31 
 
 
272 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  31.34 
 
 
264 aa  94.7  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  29.35 
 
 
271 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  29.35 
 
 
271 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1119  Cof-like hydrolase  29.92 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.78603  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  28.99 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  29.35 
 
 
271 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  25.94 
 
 
279 aa  92  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  30.8 
 
 
274 aa  92  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  28.68 
 
 
268 aa  92  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  28.84 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>