More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0369 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  100 
 
 		 272 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  100 
 
 		 272 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  100 
 
 		 272 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  100 
 
 		 272 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  100 
 
 		 272 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  99.63 
 
 		 272 aa  559  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0534  hydrolase Cof  99.26 
 
 		 272 aa  559  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3169  Cof-like hydrolase  100 
 
 		 255 aa  518  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  81.62 
 
 		 272 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  81.25 
 
 		 272 aa  467  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  81.62 
 
 		 272 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  80.88 
 
 		 272 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  81.25 
 
 		 272 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  79.04 
 
 		 272 aa  453  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  57.14 
 
 		 274 aa  330  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3044  HAD family hydrolase  57.72 
 
 		 273 aa  319  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3225  Cof-like hydrolase  57.35 
 
 		 273 aa  317  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3083  HAD family hydrolase  57.35 
 
 		 273 aa  317  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  38.64 
 
 		 265 aa  199  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  41.15 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  41.15 
 
 		 269 aa  191  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  41.15 
 
 		 269 aa  191  9e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  40 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  38.85 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  36.92 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  36.26 
 
 		 274 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  34.96 
 
 		 266 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  40.84 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  38.85 
 
 		 266 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  38.85 
 
 		 266 aa  179  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  38.85 
 
 		 266 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  38.85 
 
 		 266 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  38.85 
 
 		 266 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  38.85 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.152006 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  38.85 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  38.85 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  38.85 
 
 		 266 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  38.7 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  38.31 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  36.78 
 
 		 273 aa  175  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  36.4 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  37.16 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  36.92 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  37.16 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  37.16 
 
 		 273 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  37.16 
 
 		 280 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  37.16 
 
 		 273 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  37.16 
 
 		 273 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  37.16 
 
 		 273 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  37.5 
 
 		 274 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  36.78 
 
 		 273 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  35.11 
 
 		 270 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  37.16 
 
 		 291 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  37.16 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  35.25 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  33.72 
 
 		 273 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  35.25 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  35.25 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3291  Cof-like hydrolase  32.44 
 
 		 263 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  32.05 
 
 		 272 aa  153  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  29.7 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2727  Cof-like hydrolase  32.3 
 
 		 281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  32.26 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0427  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.85 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.635472  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0156  Cof-like hydrolase  27.06 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0069  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.66 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.707164  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  25.78 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  27.35 
 
 		 262 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  29.27 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  28.46 
 
 		 266 aa  92.4  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  29.8 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3274  Cof protein  26.14 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  29.8 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  29.8 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  29.27 
 
 		 268 aa  89.7  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  27.6 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  27.87 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  28.44 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  24.29 
 
 		 268 aa  85.9  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2353  Cof-like hydrolase  27.57 
 
 		 273 aa  85.9  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  28.4 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  24.48 
 
 		 269 aa  85.5  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  26.8 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  27.34 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  27.34 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  27.34 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  29.15 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  29.15 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  26.99 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2876  Cof-like hydrolase  27.62 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104065  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  28.99 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  25.4 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2896  phosphotransferase  27.62 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0306419  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0820  phosphotransferase  27.62 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  27.24 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4036  Cof protein  30.08 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  28.74 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>