More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3946 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  100 
 
 		 273 aa  550  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  98.9 
 
 		 273 aa  544  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  98.9 
 
 		 273 aa  544  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  98.9 
 
 		 273 aa  544  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  98.9 
 
 		 273 aa  543  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  98.9 
 
 		 273 aa  544  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  98.53 
 
 		 280 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  92.67 
 
 		 291 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  83.39 
 
 		 274 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  83.39 
 
 		 274 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  83.39 
 
 		 274 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  81.99 
 
 		 274 aa  454  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  83.27 
 
 		 273 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  80.07 
 
 		 291 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  80.07 
 
 		 277 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  77.12 
 
 		 273 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  76.38 
 
 		 273 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  74.63 
 
 		 273 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  44.87 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  42.42 
 
 		 275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  39.55 
 
 		 272 aa  202  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  40.3 
 
 		 274 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  40.67 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  40.23 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  41.42 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  39.16 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  39.55 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  40.67 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  39.55 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  39.55 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  40.3 
 
 		 266 aa  192  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  38.72 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  38.72 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.152006 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  38.72 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  38.72 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3291  Cof-like hydrolase  38.76 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  38.35 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  38.35 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  38.35 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  38.35 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  38.35 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  37.22 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  40.3 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  37.16 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  37.16 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  37.16 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  37.16 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  37.16 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  37.16 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  37.16 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0534  hydrolase Cof  36.78 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3044  HAD family hydrolase  35.88 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  36.36 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3225  Cof-like hydrolase  35.5 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3083  HAD family hydrolase  35.5 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  34.6 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  35.25 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3169  Cof-like hydrolase  36.25 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  33.72 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  33.72 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  33.72 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  33.33 
 
 		 272 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  33.33 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2727  Cof-like hydrolase  31.3 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  29.81 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  29.15 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0156  Cof-like hydrolase  28.62 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0427  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.01 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.635472  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0069  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.54 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.707164  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  25.86 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  26.67 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  28.95 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  29.85 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  26.45 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  24.81 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  32.35 
 
 		 267 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  29.17 
 
 		 268 aa  99  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  27.67 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  29.96 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1451  Cof-like hydrolase  29.09 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  27.1 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  31.62 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  29.18 
 
 		 264 aa  93.6  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  29.96 
 
 		 269 aa  92.8  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  29.55 
 
 		 268 aa  92.4  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4036  Cof protein  29.2 
 
 		 284 aa  92  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  29.92 
 
 		 268 aa  92  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  28.52 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  30.51 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  25.38 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  28.81 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  30.51 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  27.3 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  29.52 
 
 		 270 aa  90.1  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  28.16 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  30.58 
 
 		 271 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  24.32 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0795  Cof-like hydrolase  26.83 
 
 		 269 aa  89  9e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  28.35 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>