More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4150 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  100 
 
 
266 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  98.87 
 
 
266 aa  552  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  78.49 
 
 
266 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  76.23 
 
 
265 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  77.74 
 
 
266 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  77.74 
 
 
266 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  78.11 
 
 
266 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  78.11 
 
 
266 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  77.74 
 
 
266 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.152006 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  78.11 
 
 
266 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  77.36 
 
 
266 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  76.98 
 
 
269 aa  443  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  76.98 
 
 
269 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  76.32 
 
 
266 aa  442  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  76.6 
 
 
269 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  77.36 
 
 
266 aa  444  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  77.36 
 
 
266 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  77.74 
 
 
266 aa  434  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  52.85 
 
 
275 aa  287  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  52.65 
 
 
274 aa  286  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  51.14 
 
 
270 aa  277  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  49.25 
 
 
265 aa  269  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  46.64 
 
 
266 aa  259  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  39.02 
 
 
272 aa  204  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  40.6 
 
 
274 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  40.6 
 
 
274 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  40.6 
 
 
274 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  40.6 
 
 
274 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  41.04 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2727  Cof-like hydrolase  38.55 
 
 
281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  40.6 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  40.6 
 
 
291 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  41.44 
 
 
274 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  40.67 
 
 
273 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  40.67 
 
 
273 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  40.23 
 
 
273 aa  191  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  40.67 
 
 
273 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  40.67 
 
 
273 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  40.67 
 
 
273 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  40.67 
 
 
273 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  39.85 
 
 
280 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  40.3 
 
 
291 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  38.81 
 
 
273 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3291  Cof-like hydrolase  37.5 
 
 
263 aa  186  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  38.06 
 
 
273 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  38.31 
 
 
272 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  38.31 
 
 
272 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0534  hydrolase Cof  37.93 
 
 
272 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  38.31 
 
 
272 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  38.31 
 
 
272 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  38.31 
 
 
272 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  38.31 
 
 
272 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  38.31 
 
 
272 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  38.15 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  36.4 
 
 
272 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  35.88 
 
 
272 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  35.88 
 
 
272 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  35.88 
 
 
272 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  35.88 
 
 
272 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3044  HAD family hydrolase  36.02 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  35.5 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3083  HAD family hydrolase  35.63 
 
 
273 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3225  Cof-like hydrolase  35.63 
 
 
273 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3169  Cof-like hydrolase  37.08 
 
 
255 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103959  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  32.82 
 
 
266 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0156  Cof-like hydrolase  33.83 
 
 
269 aa  150  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0069  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.04 
 
 
293 aa  140  3e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.707164  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0427  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.85 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.635472  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  29.32 
 
 
262 aa  116  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  29.24 
 
 
269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  27.56 
 
 
265 aa  105  9e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  30.97 
 
 
272 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  31.65 
 
 
269 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  28.29 
 
 
262 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  28.52 
 
 
265 aa  99  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  28.63 
 
 
266 aa  99  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  31.5 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  30.58 
 
 
273 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2677  Cof-like hydrolase  30.17 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00196441  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  29.36 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  27.72 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  26.15 
 
 
274 aa  96.3  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  28.41 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  28.93 
 
 
257 aa  95.5  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  28.93 
 
 
257 aa  95.5  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  28.93 
 
 
257 aa  95.5  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.93 
 
 
257 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  26.1 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  28 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  28.74 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  28.93 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  27.6 
 
 
257 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.6 
 
 
257 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.91 
 
 
273 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  28.93 
 
 
275 aa  94  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.93 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0540  HAD superfamily hydrolase  26.72 
 
 
277 aa  94  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.467254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.52 
 
 
273 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0374  HAD superfamily hydrolase  28.31 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0519666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  28.91 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>