More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0121 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  100 
 
 		 273 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  59.49 
 
 		 278 aa  320  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  50.18 
 
 		 271 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  49.82 
 
 		 271 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  49.82 
 
 		 271 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  50.37 
 
 		 267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  50.37 
 
 		 270 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  49.82 
 
 		 277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  47.45 
 
 		 277 aa  230  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  49.26 
 
 		 273 aa  229  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  43.43 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  44.33 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  41.45 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1954  Cof-like hydrolase  42.54 
 
 		 274 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0277  Cof-like hydrolase  43.87 
 
 		 259 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  39.78 
 
 		 285 aa  185  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  44.12 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.11 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  42.44 
 
 		 264 aa  176  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  41.79 
 
 		 281 aa  175  8e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.85 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.38 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  37.69 
 
 		 272 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5588  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  38.21 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  0.729842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  36.47 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.64 
 
 		 282 aa  138  7.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.42 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0560  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.07 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0505  Cof-like hydrolase  37.72 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  36.84 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2937  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  39.93 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0182848  hitchhiker  0.000402295 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  33.82 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0279  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.53 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.333001  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  34.93 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  31.21 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0175  HAD family hydrolase  36.27 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  33.71 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  28.98 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  30.6 
 
 		 266 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  31.5 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  30.88 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.36 
 
 		 266 aa  106  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452319  hitchhiker  0.00105022 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  29.24 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.19 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  29.24 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  29.24 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  29.24 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  29.24 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.24 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.24 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  28.93 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.24 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0380  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.9 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.890791 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  29.51 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  29.6 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.69 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  27.44 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.88 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  26.69 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  26.69 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  28.83 
 
 		 267 aa  99.8  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  26.35 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  27.5 
 
 		 273 aa  99  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0141  Cof-like hydrolase  32.84 
 
 		 284 aa  99  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.25 
 
 		 261 aa  99  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00675343  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  26.91 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  30.6 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  28.73 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  27.08 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  30.58 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0299  Cof-like hydrolase  32.12 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  27.8 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  27.02 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0615  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.48 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  29.35 
 
 		 267 aa  96.3  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  30 
 
 		 266 aa  95.9  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.45 
 
 		 275 aa  95.5  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.616457 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  29.75 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.21 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.324919  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  33.09 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.61 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  22.68 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  29.26 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  25.64 
 
 		 277 aa  92.8  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  32.26 
 
 		 272 aa  92.4  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  27.08 
 
 		 276 aa  92.4  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7133  Cof-like hydrolase  32.85 
 
 		 266 aa  92  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  28.68 
 
 		 273 aa  92  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0217  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  26.35 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  24.91 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  29.12 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  29.89 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.46 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  28.32 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  29.46 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  29.46 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  29.46 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  29.46 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  25.09 
 
 		 268 aa  90.1  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>