More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7012 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 		 261 aa  490  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00675343  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0175  HAD family hydrolase  41.39 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.08 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.616457 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  44.4 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.15 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452319  hitchhiker  0.00105022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.97 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0299  Cof-like hydrolase  39.92 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0141  Cof-like hydrolase  38.78 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0380  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  40.84 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.890791 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.77 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  36.8 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  36.57 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.63 
 
 		 288 aa  118  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.324919  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  34.2 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  36.3 
 
 		 271 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  35.93 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  35.93 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.5 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.454773 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01730  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.45 
 
 		 311 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  35.61 
 
 		 273 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.78 
 
 		 278 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  34.57 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  37.26 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  34.57 
 
 		 277 aa  102  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  31.07 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  30.43 
 
 		 268 aa  99.4  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  33.71 
 
 		 268 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  32.45 
 
 		 265 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  30.55 
 
 		 279 aa  99  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  30.94 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  30.94 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  30.94 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  30.94 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  30.94 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  30.94 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  30.94 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  36.43 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  30.22 
 
 		 271 aa  96.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  30.94 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  26.47 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  26.52 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  26.54 
 
 		 267 aa  95.9  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  27.84 
 
 		 273 aa  95.5  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1954  Cof-like hydrolase  36.02 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  34.94 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  29 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  28.21 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  28.83 
 
 		 269 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  30.58 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  28.83 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  32.58 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3223  Cof-like hydrolase  31.18 
 
 		 273 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  33.46 
 
 		 281 aa  93.2  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  30.71 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.24 
 
 		 273 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  25.45 
 
 		 276 aa  92.4  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  30.22 
 
 		 281 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  27.74 
 
 		 270 aa  92  8e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  26.83 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  28.47 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0277  Cof-like hydrolase  35.34 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  26.83 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  26.83 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  26.83 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  29.23 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  29.37 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  26.83 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  25.45 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  23.72 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  34.31 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  30.51 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.83 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.83 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.83 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  29 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  26.82 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  33.96 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0120  Cof-like hydrolase  29.71 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  27.47 
 
 		 273 aa  89.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  28.25 
 
 		 266 aa  89  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  28.62 
 
 		 274 aa  88.6  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  25.61 
 
 		 273 aa  88.6  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  29.6 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  27.97 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  26.69 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  30.43 
 
 		 270 aa  86.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.46 
 
 		 267 aa  86.3  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  30.34 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  28.25 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  30.83 
 
 		 269 aa  85.9  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  32.2 
 
 		 272 aa  85.9  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  30.6 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf285  COF family HAD hydrolase protein  24.81 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0114405  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  32.13 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  27.08 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0986  hypothetical protein  27.1 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2883  Cof-like hydrolase  30.71 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  29.2 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>