More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0141 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0141  Cof-like hydrolase  100 
 
 
284 aa  580  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0299  Cof-like hydrolase  83.01 
 
 
259 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  65.13 
 
 
269 aa  332  4e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  52.63 
 
 
288 aa  271  6e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.324919  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  50.77 
 
 
266 aa  249  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452319  hitchhiker  0.00105022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  52.49 
 
 
275 aa  246  3e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.616457 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  48.65 
 
 
274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  49.03 
 
 
265 aa  234  9e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0380  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  47.49 
 
 
295 aa  229  5e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.890791 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01730  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  47.1 
 
 
311 aa  221  9e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  40.84 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.454773 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0175  HAD family hydrolase  39.77 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  33.21 
 
 
271 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  35.45 
 
 
270 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  35.58 
 
 
267 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  35.71 
 
 
271 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  35.34 
 
 
271 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  35.34 
 
 
271 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.78 
 
 
261 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00675343  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  32.97 
 
 
273 aa  106  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  34.87 
 
 
264 aa  105  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  31.64 
 
 
268 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  33.59 
 
 
264 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  32.84 
 
 
273 aa  99  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  33.09 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  31.6 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  33.09 
 
 
272 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.84 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.11 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  30.15 
 
 
273 aa  94  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  30.69 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.7 
 
 
290 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  27.68 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  28.72 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  25.27 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  30.45 
 
 
265 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  30.4 
 
 
285 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  28.14 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  26.94 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  26.41 
 
 
268 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  31.58 
 
 
281 aa  85.9  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  29.18 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  24.63 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.38 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  27.38 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  27.38 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  26.71 
 
 
268 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.63 
 
 
271 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  27.38 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.38 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  30.04 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  25.18 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  27.38 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  27.38 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl513  HAD-superfamily cof-like hydrolase  24.52 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.38 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  26.07 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1162  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.352736  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0607  Cof-like hydrolase  30.83 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000496024  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  31.48 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0615  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.22 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  24.26 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  25.53 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.37 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  29.82 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  29.06 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.8 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  29.71 
 
 
277 aa  79  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0138  Cof-like hydrolase  30.31 
 
 
279 aa  79  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0213598  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  24.07 
 
 
269 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  25.93 
 
 
266 aa  79  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  26.74 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  27.44 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  28.83 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  26.06 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1895  HAD superfamily hydrolase  28.17 
 
 
278 aa  77  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000132103  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  24.18 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  24.18 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  23.44 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  25.18 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  23.44 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  25.48 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  25.56 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  29.63 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  23.44 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.35 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  23.81 
 
 
269 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  23.81 
 
 
269 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  23.81 
 
 
269 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.81 
 
 
269 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  23.81 
 
 
269 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  26.67 
 
 
272 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2883  Cof-like hydrolase  29.51 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.81 
 
 
269 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.22 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  28.42 
 
 
272 aa  75.5  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  25.9 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  25.9 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>