More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1028 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  100 
 
 
271 aa  560  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  89.67 
 
 
271 aa  509  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  90.04 
 
 
271 aa  508  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  31.9 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  30 
 
 
274 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  30.43 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  28.31 
 
 
278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  31.48 
 
 
269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  29.79 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  30.18 
 
 
273 aa  119  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  31.03 
 
 
279 aa  119  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  29.3 
 
 
269 aa  118  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  31.48 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  29.79 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  31.48 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  30.4 
 
 
266 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  32.49 
 
 
268 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  30.22 
 
 
268 aa  116  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  30.04 
 
 
266 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  27.4 
 
 
267 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  32.27 
 
 
268 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  28.25 
 
 
273 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  29 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  27.3 
 
 
269 aa  109  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  29.89 
 
 
279 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  29.47 
 
 
273 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  27.86 
 
 
277 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  28.52 
 
 
273 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1138  Cof protein  30.74 
 
 
265 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0691805  normal  0.0113542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  32.48 
 
 
269 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2702  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.55 
 
 
283 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  27.37 
 
 
268 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  29.33 
 
 
268 aa  106  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  30.04 
 
 
271 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  28.87 
 
 
283 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  27.94 
 
 
270 aa  105  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2666  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.11 
 
 
283 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.968723  normal  0.0125888 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  26.62 
 
 
276 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  29.86 
 
 
284 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  25.93 
 
 
269 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  26.28 
 
 
276 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  28.42 
 
 
283 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  27.92 
 
 
460 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  31.41 
 
 
269 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  28.87 
 
 
283 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2024  Cof-like hydrolase  31.21 
 
 
281 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
268 aa  104  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  27.24 
 
 
268 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2883  Cof-like hydrolase  32.03 
 
 
282 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  31.41 
 
 
269 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  31.41 
 
 
269 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  31.41 
 
 
269 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  28.52 
 
 
283 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  31.41 
 
 
269 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.41 
 
 
269 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.41 
 
 
269 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  26.88 
 
 
273 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  27.05 
 
 
285 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  28.52 
 
 
283 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  28.52 
 
 
283 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.52 
 
 
283 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0253  HAD superfamily hydrolase  29.01 
 
 
290 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  30.04 
 
 
272 aa  102  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  27.92 
 
 
270 aa  102  7e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.52 
 
 
283 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  27.88 
 
 
265 aa  102  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  30.42 
 
 
274 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.75 
 
 
269 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  27.17 
 
 
268 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  27.65 
 
 
257 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  32.63 
 
 
271 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  28.52 
 
 
272 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.65 
 
 
257 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3223  Cof-like hydrolase  28.37 
 
 
273 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  27.2 
 
 
262 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.77 
 
 
290 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0246  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.96 
 
 
290 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  28.14 
 
 
257 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  28.14 
 
 
257 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  29.37 
 
 
268 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  27.65 
 
 
257 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  28.14 
 
 
257 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  26.15 
 
 
274 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0795  Cof-like hydrolase  27.96 
 
 
269 aa  101  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.14 
 
 
257 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  27.05 
 
 
273 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.39 
 
 
269 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  31.05 
 
 
269 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.77 
 
 
290 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2879  phosphotransferase  27.6 
 
 
273 aa  99.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  29.01 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.46 
 
 
273 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2045  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.09 
 
 
280 aa  99.4  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0672209  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0224  Cof-like hydrolase  28.28 
 
 
290 aa  99.4  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0213  Cof-like hydrolase  28.77 
 
 
319 aa  99.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0210  HAD superfamily hydrolase  28.77 
 
 
319 aa  99.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0214  HAD superfamily hydrolase  29.11 
 
 
319 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  26.55 
 
 
273 aa  99  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  29 
 
 
266 aa  99  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.06 
 
 
273 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>