More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3056 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  100 
 
 
273 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  93.77 
 
 
273 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1180  phosphotransferase  69.85 
 
 
273 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  68.13 
 
 
273 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  67.77 
 
 
273 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2879  phosphotransferase  70.33 
 
 
273 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  67.77 
 
 
273 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1306  phosphotransferase  66.54 
 
 
274 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  59.56 
 
 
306 aa  348  6e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  59.56 
 
 
272 aa  347  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  59.56 
 
 
272 aa  346  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  59.19 
 
 
272 aa  345  4e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2876  Cof-like hydrolase  59.56 
 
 
272 aa  345  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0820  phosphotransferase  59.56 
 
 
272 aa  345  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0848  phosphotransferase  60.29 
 
 
286 aa  345  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2896  phosphotransferase  59.56 
 
 
272 aa  345  5e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0306419  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  61.4 
 
 
272 aa  345  5e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0911  phosphotransferase  60.29 
 
 
286 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0934  phosphotransferase  60.29 
 
 
286 aa  343  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.600795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0879  phosphotransferase  60.29 
 
 
286 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0820  phosphotransferase  60.29 
 
 
286 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  44.65 
 
 
273 aa  235  6e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  38.66 
 
 
244 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  38.66 
 
 
244 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  38.29 
 
 
244 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0120  Cof-like hydrolase  39.26 
 
 
274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0986  hypothetical protein  37.5 
 
 
273 aa  169  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  31.84 
 
 
273 aa  129  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  27.8 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  28.37 
 
 
279 aa  119  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  28.1 
 
 
274 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  29.41 
 
 
267 aa  116  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  26.28 
 
 
277 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  26.91 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  26.28 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  26.91 
 
 
276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.26 
 
 
271 aa  112  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  27.54 
 
 
271 aa  110  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  29 
 
 
271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  26.03 
 
 
279 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
272 aa  108  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  27.37 
 
 
268 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  28.67 
 
 
274 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1298  HAD superfamily hydrolase  29.43 
 
 
286 aa  106  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000863241  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  30.54 
 
 
289 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  30.54 
 
 
289 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0231  Cof-like hydrolase  26.57 
 
 
273 aa  105  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  31 
 
 
269 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  25.34 
 
 
279 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  29.86 
 
 
268 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  30.63 
 
 
269 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.63 
 
 
269 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  30.63 
 
 
269 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  31.18 
 
 
268 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  30.63 
 
 
269 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  30.63 
 
 
269 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  30.63 
 
 
269 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.63 
 
 
269 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  28.98 
 
 
273 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0214  HAD superfamily hydrolase  27.68 
 
 
319 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0213  Cof-like hydrolase  27.68 
 
 
319 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0246  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.62 
 
 
290 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0210  HAD superfamily hydrolase  26.99 
 
 
319 aa  99.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  26.81 
 
 
285 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.97 
 
 
290 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.26 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0205  HAD superfamily hydrolase  31.16 
 
 
292 aa  98.6  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.855458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0253  HAD superfamily hydrolase  27.27 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.26 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0250  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.27 
 
 
290 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  30.11 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  30.11 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  28.78 
 
 
273 aa  97.4  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.92 
 
 
290 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  30.34 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  27.37 
 
 
268 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  26.45 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  28.77 
 
 
271 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  22.99 
 
 
269 aa  95.9  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0923  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.89 
 
 
290 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  28.1 
 
 
271 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  28.1 
 
 
271 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  25.98 
 
 
268 aa  95.9  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  26.64 
 
 
271 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0960  HAD superfamily hydrolase  29.54 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0774  HAD superfamily hydrolase  29.54 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0775  HAD superfamily hydrolase  29.54 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  25.18 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4407  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.54 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2024  Cof-like hydrolase  29.58 
 
 
281 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0961  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.18 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2702  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.17 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1049  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.18 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0224  Cof-like hydrolase  26.99 
 
 
290 aa  93.6  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  28.04 
 
 
269 aa  94  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  27.68 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  27.21 
 
 
460 aa  93.2  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  26.41 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0775  HAD family hydrolase  29.54 
 
 
290 aa  93.2  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  28.06 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>