More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2045 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2045  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 
280 aa  554  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0672209  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1561  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  64.94 
 
 
278 aa  338  8e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.100499  normal  0.0550731 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1562  Cof-like hydrolase  43.27 
 
 
272 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104668  normal  0.0533762 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2044  Cof-like hydrolase  43.07 
 
 
271 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0133018  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1138  Cof protein  42.42 
 
 
265 aa  159  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0691805  normal  0.0113542 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.09 
 
 
271 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  33.09 
 
 
271 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  33.46 
 
 
271 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  29.45 
 
 
271 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  29.68 
 
 
268 aa  87  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0457  Cof-like hydrolase  29.56 
 
 
282 aa  86.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  26.87 
 
 
269 aa  85.5  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  26.62 
 
 
279 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  26.26 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  27.47 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  27.54 
 
 
272 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  29.29 
 
 
279 aa  82  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1451  Cof-like hydrolase  26.26 
 
 
276 aa  82  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  28.83 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  28.47 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  31.54 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  27.34 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1274  Cof-like hydrolase  28.32 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442966  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  28.47 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  28.47 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  28.47 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  28.47 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  28.47 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  28.47 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  28.47 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  31 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  28.47 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0138  Cof-like hydrolase  29.45 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0213598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  28.47 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  28.68 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  28.94 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1752  HAD family hydrolase  29.35 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00695054  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  25.89 
 
 
266 aa  79  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  28.68 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  27.8 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  28.57 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  24.9 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  27.02 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1097  HAD superfamily hydrolase  28.12 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000207763  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  26.98 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  24.01 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0607  Cof-like hydrolase  30.66 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000496024  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  26.88 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  28.21 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  29.45 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  27.78 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  26.98 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  26.92 
 
 
269 aa  75.5  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  28.91 
 
 
274 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  25.09 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  26.97 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  28.89 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  26.83 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  26.83 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.83 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  26.83 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  26.83 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  27.14 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  28.47 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.56 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  27.08 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6319  putative Cof hydrolase  26.98 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171761  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  27.68 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  27.54 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  27.44 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  26.52 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2677  Cof-like hydrolase  26.92 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00196441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  27.24 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.42 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  30.32 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  26.37 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  26.37 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  26.37 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.37 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  27.17 
 
 
269 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  26.3 
 
 
269 aa  72  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.56 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  26.42 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.56 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  24.47 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  28.74 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0259  Cof-like hydrolase  23.1 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000719541  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  25.62 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  25.55 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  29.14 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  27.68 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  23.53 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1083  Cof-like hydrolase  23.08 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  28.42 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  27.31 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  24.64 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0258  Cof-like hydrolase  23.81 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000345946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  26.01 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3240  hydrolase  26.87 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0554089  normal  0.223166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>