More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3948 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  100 
 
 		 274 aa  570  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  32.84 
 
 		 279 aa  165  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  32.47 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  30.97 
 
 		 281 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  30.97 
 
 		 281 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  31.37 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  30.97 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  30.97 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  30.6 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  30.6 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  30.6 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  30.6 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  30.6 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  30.6 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  30.6 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  30.6 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  30.6 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  31.37 
 
 		 271 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  31.95 
 
 		 277 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  30.63 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  31.02 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  30.22 
 
 		 270 aa  145  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  30.4 
 
 		 269 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  30.4 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  30.04 
 
 		 269 aa  142  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  30.22 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  32.18 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  30.6 
 
 		 270 aa  138  8.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  32.22 
 
 		 273 aa  135  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  27.44 
 
 		 266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  29.15 
 
 		 268 aa  135  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  27.44 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  32.37 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  29.89 
 
 		 268 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  31.41 
 
 		 273 aa  131  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  29.33 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  29.43 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1509  HAD superfamily hydrolase  33.93 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  29.68 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  29.43 
 
 		 279 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  29.93 
 
 		 279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  27.84 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  35.14 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  29.03 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  29.75 
 
 		 277 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1405  Cof-like hydrolase  28.84 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  29.82 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  25.47 
 
 		 269 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  27.88 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1176  HAD superfamily hydrolase  31.25 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.534777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  31.54 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  25.46 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  27.64 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1845  HAD superfamily hydrolase  28.47 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1097  HAD superfamily hydrolase  31 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000207763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  29.58 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4408  putative conserved hypothetical protein  30.77 
 
 		 287 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0949977 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2000  HAD superfamily hydrolase  31.41 
 
 		 273 aa  115  7.999999999999999e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4533  hypothetical protein  30.4 
 
 		 287 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  33.21 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4607  hypothetical protein  30.77 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.356417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  28.93 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  30 
 
 		 265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  26.69 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  32.04 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  27.41 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  30.58 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  27.7 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  28.88 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0120  Cof-like hydrolase  32.86 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  29.52 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0217  Cof-like hydrolase  27.44 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.52 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  30.22 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  27.76 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  27.18 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  27.94 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  27.88 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.88 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  26.79 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.94 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  30.14 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.88 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4000  Cof-like hydrolase  28.73 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1225  HAD superfamily hydrolase  25.93 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.88 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  27.88 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  27.88 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  27.88 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  27.88 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  26.77 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4042  Cof-like hydrolase  28.73 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  27.74 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  26.15 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  28.06 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  28.1 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  28.25 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0607  Cof-like hydrolase  29.82 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000496024  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  29.96 
 
 		 272 aa  99  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  25.48 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>