More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1001 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 		 271 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  98.52 
 
 		 271 aa  552  1e-156  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  90.04 
 
 		 271 aa  508  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  32.38 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  32.37 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  31.85 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  31.85 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  33.21 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  31.48 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  29.66 
 
 		 279 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  29.89 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  29.03 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  29.09 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  30.69 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  30.04 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  32.27 
 
 		 268 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  31.1 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  28.62 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  29.2 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  28.52 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  29.15 
 
 		 273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1138  Cof protein  31.95 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0691805  normal  0.0113542 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  29.27 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  30.88 
 
 		 279 aa  112  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  28.26 
 
 		 273 aa  112  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  26.9 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  28.21 
 
 		 269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  27.74 
 
 		 273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  28.78 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  27.78 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  25.85 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  29.18 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  27.74 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  30.56 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2883  Cof-like hydrolase  32.5 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  28.31 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  28.74 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  28.17 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.04 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  26.33 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  29.66 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  29.66 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  28.52 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  29.66 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  28.52 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  28.27 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  27.96 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.66 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2024  Cof-like hydrolase  30.99 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.64 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  28.52 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  29.64 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  29.25 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2045  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.09 
 
 		 280 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0672209  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  32.98 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  29.25 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  29.25 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.25 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  29.25 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  29.25 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  28.07 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  28.79 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  27.78 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  29.28 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  27.24 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  29.25 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.25 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.79 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0246  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.62 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  32.4 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2702  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.47 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  28.72 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  27.44 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.28 
 
 		 290 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0258  Cof-like hydrolase  28.46 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000345946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  31.27 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0253  HAD superfamily hydrolase  28.52 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0213  Cof-like hydrolase  27.89 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  30.39 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  28.07 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1162  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.63 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.352736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.17 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.42 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  30.5 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  27.72 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  27.92 
 
 		 460 aa  103  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0214  HAD superfamily hydrolase  28.77 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  30.88 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  25.81 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0210  HAD superfamily hydrolase  28.42 
 
 		 319 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  31.05 
 
 		 269 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  28.63 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  31.05 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  31.05 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  31.05 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  31.05 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.05 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.05 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0224  Cof-like hydrolase  27.95 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>