More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1138 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1138  Cof protein  100 
 
 		 265 aa  527  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0691805  normal  0.0113542 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2045  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.42 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0672209  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1561  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  38.87 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.100499  normal  0.0550731 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1562  Cof-like hydrolase  36.59 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104668  normal  0.0533762 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2044  Cof-like hydrolase  31.85 
 
 		 271 aa  125  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0133018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.95 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  31.95 
 
 		 271 aa  119  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  30.74 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  30.63 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1451  Cof-like hydrolase  27.11 
 
 		 276 aa  97.1  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 		 278 aa  95.5  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  29.91 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  28.62 
 
 		 286 aa  92.8  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  29.59 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  27.54 
 
 		 262 aa  92  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  28.41 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  31.6 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  26.04 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  27.92 
 
 		 273 aa  89.4  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  23.36 
 
 		 269 aa  89.4  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  27.99 
 
 		 271 aa  89.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.27 
 
 		 273 aa  89  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  25.19 
 
 		 266 aa  88.6  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  25.56 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  26.71 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  27.46 
 
 		 271 aa  87  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  29.91 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  29.91 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  29.91 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  29.91 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.91 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  26.91 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  28.1 
 
 		 268 aa  87  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.27 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  29.91 
 
 		 273 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  25.09 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  28.38 
 
 		 273 aa  85.9  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  29.26 
 
 		 269 aa  85.9  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  29.26 
 
 		 269 aa  85.5  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  27.34 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0607  Cof-like hydrolase  32.08 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000496024  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  26.1 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  33.97 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.46 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  25.37 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  28.89 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  29.48 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  28.9 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  30.12 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  25.09 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  27.82 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  28.16 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  25.27 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  27.54 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  27.31 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  27.54 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1298  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000863241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  25.2 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  24.71 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  28.46 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  24.81 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  28.09 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  25.56 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  25.47 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  28.09 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  25.47 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  25.47 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0138  Cof-like hydrolase  27.11 
 
 		 279 aa  78.6  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0213598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  25.47 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  25.47 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  25.47 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  23.88 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf524  COF family HAD hydrolase protein  24.09 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  24.15 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  24.28 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  27.56 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1176  HAD superfamily hydrolase  27.44 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.534777  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4042  Cof-like hydrolase  29.41 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  29.3 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  27.72 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  25.47 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  27.41 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  25.47 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  24.71 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  29.85 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  32.46 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  24.71 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4000  Cof-like hydrolase  29.04 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  27.11 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.81 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  29.15 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  25.62 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2618  HAD family hydrolase  29.61 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  25.44 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  23.62 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3223  Cof-like hydrolase  26.74 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  28.84 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1752  HAD family hydrolase  26.84 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00695054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0762  Cof-like hydrolase  24.82 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>