More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1562 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1562  Cof-like hydrolase  100 
 
 		 272 aa  546  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104668  normal  0.0533762 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2044  Cof-like hydrolase  67.42 
 
 		 271 aa  378  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0133018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1561  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  40.44 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.100499  normal  0.0550731 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2045  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  43.27 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0672209  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1138  Cof protein  36.59 
 
 		 265 aa  119  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0691805  normal  0.0113542 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  25.36 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  27.34 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  27.6 
 
 		 271 aa  89  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  26.67 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  29.64 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  27.99 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  29 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  29.2 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  26.55 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  28.78 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  25.27 
 
 		 279 aa  85.9  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  27.92 
 
 		 273 aa  85.9  6e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  28.78 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  23.74 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  28.52 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  27.5 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  29.39 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  25.47 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  26.98 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3317  Cof-like hydrolase  23.95 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000026375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  26.79 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  27.68 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0716  HAD family phosphatase  23.86 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  28.78 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  25.99 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  30.47 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  27.44 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  28.26 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  27.44 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  26.55 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  27.85 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  27.08 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  24.63 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  27.68 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0365  HAD superfamily hydrolase  24.38 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.231869  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  24.82 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  23.47 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6319  putative Cof hydrolase  26.09 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  48.68 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  27.7 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  35.9 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  26.77 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0457  Cof-like hydrolase  28.23 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  25.35 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  24.18 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1083  Cof-like hydrolase  20.51 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  26.74 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  25.81 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  25.81 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  25.81 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0762  Cof-like hydrolase  26.99 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  25.58 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  28 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0253  HAD superfamily hydrolase  24.91 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  22.94 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  25.69 
 
 		 281 aa  72  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  28.72 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  28.72 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  42.67 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  28.72 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.17 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  28.72 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  28.72 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0213  Cof-like hydrolase  24 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0732  Cof-like hydrolase  26.48 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  29.81 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  26.6 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  25.17 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  25.17 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  28.72 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  25.17 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  28.72 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  28.78 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  27.02 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1097  HAD superfamily hydrolase  46.05 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000207763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  28.72 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4000  Cof-like hydrolase  28.15 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  28.37 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  25 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  39.62 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  28.78 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0246  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.16 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0214  HAD superfamily hydrolase  24.08 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  24.54 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  25.28 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf285  COF family HAD hydrolase protein  24.54 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0114405  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  28.78 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  28.78 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  25.75 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  26.39 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0210  HAD superfamily hydrolase  23.75 
 
 		 319 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  28.78 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2353  Cof-like hydrolase  26.64 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.13 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>