More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2618 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2618  HAD family hydrolase  100 
 
 		 261 aa  521  1e-147  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1737  HAD family hydrolase  38.58 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0411351 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  32.26 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  27.13 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf524  COF family HAD hydrolase protein  25.93 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  25.11 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  25.11 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  30.93 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  25.11 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0732  Cof-like hydrolase  23.94 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  26.1 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  29.74 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  28.99 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0457  Cof-like hydrolase  27.73 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  27.17 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1138  Cof protein  29 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0691805  normal  0.0113542 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  26.85 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  26.77 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  27.27 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  24.24 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  26.77 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  24 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2883  Cof-like hydrolase  29.56 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  26.56 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01730  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.68 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  28.87 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  27.24 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4533  hypothetical protein  26.34 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  23.41 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  25.5 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  23.86 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  29.84 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  24.42 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4607  hypothetical protein  25.73 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.356417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  24.6 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  26.59 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2024  Cof-like hydrolase  28.85 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2353  Cof-like hydrolase  26.52 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  27.47 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  26.67 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  28.1 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  26.38 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0250  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.38 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1851  Cof-like hydrolase  26.61 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  26.97 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0427  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.45 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.635472  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  27.24 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  25.73 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  28.22 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  28.69 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0700  putative HAD superfamily hydrolase  27.85 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  28.1 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  28.1 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  23.55 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  28.16 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  24.61 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  25.58 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  26.29 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  25.2 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.17 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  24.63 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  26.56 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.97 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1176  HAD superfamily hydrolase  26.3 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.534777  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  25.5 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  24.63 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  26.61 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  22.09 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1083  Cof-like hydrolase  22.08 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  26.56 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.76 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  25.79 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3074  Cof-like hydrolase  26.18 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  25.79 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0253  HAD superfamily hydrolase  24.53 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  24.03 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1482  Cof-like hydrolase  26.52 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00113579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  30.74 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  28.57 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  25.2 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  28.57 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  28.57 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.2 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  28.57 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  28.57 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0559  putative HAD superfamily hydrolase  25.78 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0605487  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2666  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.42 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.968723  normal  0.0125888 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  25.28 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  24.03 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  24.03 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  24.03 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  29.79 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  27.1 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  23.19 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.03 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  24.8 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  26.14 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>