More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1574 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  100 
 
 
261 aa  541  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  40.38 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  40 
 
 
262 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  37.84 
 
 
265 aa  193  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  36.19 
 
 
265 aa  186  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  36.19 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  33.84 
 
 
283 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  37.08 
 
 
279 aa  171  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  35.98 
 
 
287 aa  169  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.88 
 
 
282 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.58 
 
 
281 aa  152  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1878  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.58 
 
 
270 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  29.28 
 
 
265 aa  138  8.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  30.04 
 
 
263 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  32.7 
 
 
271 aa  136  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  33.08 
 
 
271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1793  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.42 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324577  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  32.7 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  32.7 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  32.7 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  32.7 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  32.7 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  32.7 
 
 
271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2405  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.66 
 
 
263 aa  132  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  32.7 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  29.06 
 
 
271 aa  129  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  30.42 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  30.42 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  30.42 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  30.42 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  30.42 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  30 
 
 
263 aa  125  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  32.53 
 
 
256 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  32.83 
 
 
271 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  32.83 
 
 
271 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  32.83 
 
 
271 aa  123  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  32.83 
 
 
271 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  32.83 
 
 
271 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  32.83 
 
 
271 aa  123  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  32.66 
 
 
264 aa  123  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  32.83 
 
 
271 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  30.08 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  33.33 
 
 
271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  30.3 
 
 
270 aa  115  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  32.96 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  33.33 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  33.33 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  33.33 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  32.83 
 
 
271 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  32.95 
 
 
271 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  29.92 
 
 
265 aa  112  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2548  Cof-like hydrolase  31.6 
 
 
266 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0286905  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2600  Cof-like hydrolase  31.6 
 
 
266 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.20198  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2088  HAD superfamily hydrolase  31 
 
 
269 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.656055  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  27.14 
 
 
270 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  27.27 
 
 
270 aa  104  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  30.19 
 
 
262 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  29.96 
 
 
273 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  26.97 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2070  HAD superfamily hydrolase  29.63 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208936  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  27.57 
 
 
272 aa  98.6  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1558  HAD superfamily hydrolase  28.52 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2677  Cof-like hydrolase  27.61 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00196441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.97 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0971  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  26.97 
 
 
257 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  26.22 
 
 
257 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  26.22 
 
 
257 aa  95.1  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  26.22 
 
 
257 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.22 
 
 
257 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  26.87 
 
 
262 aa  95.5  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  28.41 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  26.22 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.22 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1559  HAD superfamily hydrolase  27.92 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.847302  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1162  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.22 
 
 
257 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.352736  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  28.68 
 
 
268 aa  92.8  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  29.63 
 
 
271 aa  92  9e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  25.98 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  29.58 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  28.63 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  27.21 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  25.64 
 
 
272 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2352  Cof-like hydrolase  26.57 
 
 
292 aa  89.7  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  26.09 
 
 
273 aa  89.4  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0836  HAD superfamily hydrolase  24.91 
 
 
273 aa  89  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.781364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2762  Cof-like hydrolase  27.2 
 
 
261 aa  89  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0815  HAD superfamily hydrolase  26.95 
 
 
274 aa  89  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.493378  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  27.74 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  29.35 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0545  hydrolase  27.92 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0949  Cof-like hydrolase  25.1 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000135628  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  24.54 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1845  HAD superfamily hydrolase  26.02 
 
 
269 aa  86.3  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  22.88 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  26.88 
 
 
273 aa  85.9  6e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  26.2 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  27.96 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  28.36 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0716  HAD family phosphatase  28.46 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>