More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0488 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 268 aa  550  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  36.94 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  36.94 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  36.94 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  36.94 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  36.94 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  36.94 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  36.19 
 
 		 270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  36.94 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  36.94 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  36.94 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  36.94 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  36.94 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  35.82 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  35.58 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  35.07 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  35.06 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  36.57 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  35.69 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  34.33 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  33.33 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  33.33 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1845  HAD superfamily hydrolase  34.69 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  32.96 
 
 		 269 aa  162  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  33.21 
 
 		 273 aa  159  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  32.84 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  34.31 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1509  HAD superfamily hydrolase  37.04 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  34.7 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  33.58 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  32.46 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1176  HAD superfamily hydrolase  33.21 
 
 		 271 aa  148  8e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.534777  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  33.09 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  36.03 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  32.61 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  32.48 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  32.09 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  31.95 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  31.88 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  32.71 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0231  Cof-like hydrolase  34.21 
 
 		 273 aa  142  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  32.23 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  31.97 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  34.07 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  31.62 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  33.09 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1097  HAD superfamily hydrolase  32.97 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000207763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  32.96 
 
 		 268 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  29.89 
 
 		 274 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  32.06 
 
 		 270 aa  131  9e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1446  Cof-like hydrolase  33.21 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  31.48 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 		 273 aa  125  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  28.62 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1225  HAD superfamily hydrolase  30.66 
 
 		 266 aa  123  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  28.25 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  27.61 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1653  hypothetical protein  28.52 
 
 		 407 aa  119  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  31.52 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1405  Cof-like hydrolase  30.22 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  29.82 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0217  Cof-like hydrolase  30.57 
 
 		 269 aa  119  7e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  31.34 
 
 		 267 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  31.34 
 
 		 267 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  30.21 
 
 		 279 aa  115  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  28.83 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  28.21 
 
 		 279 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  28.62 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  31.14 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  32.42 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  30.96 
 
 		 273 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  29.37 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  28.16 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  28.36 
 
 		 266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  28.62 
 
 		 262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  27.82 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  26.2 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.17 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2352  Cof-like hydrolase  28.09 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2161  Cof-like hydrolase  31.02 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.68 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  30.68 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  30.28 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.28 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  30.28 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  30.28 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  30.28 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.68 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4036  Cof protein  28.88 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  29.27 
 
 		 460 aa  106  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  30.2 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.88 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  28.16 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1927  Cof-like hydrolase  29.79 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107628  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  28.16 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1882  HAD superfamily hydrolase  28.32 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0795  Cof-like hydrolase  30.26 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  26.98 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2067  hydrolase  29.75 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.347224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>