More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01730 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01730  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 		 311 aa  604  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  50.19 
 
 		 274 aa  243  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  50.58 
 
 		 266 aa  231  8.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.454773 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  45.35 
 
 		 275 aa  222  6e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.616457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0141  Cof-like hydrolase  47.1 
 
 		 284 aa  222  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  50.97 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  48.46 
 
 		 269 aa  219  5e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0299  Cof-like hydrolase  47.1 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  45.8 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452319  hitchhiker  0.00105022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0380  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  45.38 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.890791 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  40.62 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.324919  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0175  HAD family hydrolase  38.49 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  33.21 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  34.83 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  33.83 
 
 		 270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  33.71 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  33.71 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  33.08 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  27.14 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.19 
 
 		 261 aa  96.3  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00675343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  31.16 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  34.57 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  29.14 
 
 		 268 aa  93.2  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  31.99 
 
 		 268 aa  92.4  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  26.79 
 
 		 273 aa  92.4  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0732  Cof-like hydrolase  25.78 
 
 		 287 aa  92.4  9e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  33.83 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  27.37 
 
 		 269 aa  90.5  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  26.52 
 
 		 272 aa  89.4  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  32.82 
 
 		 264 aa  89.4  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  26.88 
 
 		 273 aa  89  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  25 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  28.31 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  28.41 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  29.63 
 
 		 267 aa  87.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0374  HAD superfamily hydrolase  26.6 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0519666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  25.64 
 
 		 279 aa  87  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  30.42 
 
 		 273 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  31.78 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  29.54 
 
 		 268 aa  85.9  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  27.14 
 
 		 279 aa  85.5  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  30.86 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  28.42 
 
 		 265 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  26.16 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.48 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  29.62 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  28.78 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  26.98 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  25.81 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  23.83 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf285  COF family HAD hydrolase protein  25.74 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0114405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  23.83 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.11 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  27.37 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  27.88 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  25.99 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  24.66 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0250  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.75 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  26.37 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1851  Cof-like hydrolase  24.82 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  27.14 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  27.07 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  27.31 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.11 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0246  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.11 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  27.57 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  32.35 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  24.06 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0253  HAD superfamily hydrolase  30.82 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  27.01 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  26.33 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  29.52 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  28.46 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0214  HAD superfamily hydrolase  30.29 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1097  HAD superfamily hydrolase  26.52 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000207763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  30.8 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0210  HAD superfamily hydrolase  30.29 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1083  Cof-like hydrolase  26.14 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  25.38 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  26.94 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0213  Cof-like hydrolase  30.29 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  28.88 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.24 
 
 		 257 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  30.74 
 
 		 272 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  25.34 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  24.24 
 
 		 257 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  24.24 
 
 		 257 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl513  HAD-superfamily cof-like hydrolase  25.97 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  25.34 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  25.34 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  24.24 
 
 		 257 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.34 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  25.95 
 
 		 279 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  25.83 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  30.26 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  25.64 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  24.82 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.64 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.03 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>