More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07610 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 
265 aa  520  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0560  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  49.24 
 
 
265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0505  Cof-like hydrolase  55.4 
 
 
303 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  46.39 
 
 
265 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  44.32 
 
 
264 aa  198  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  43.87 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  43.33 
 
 
285 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  40.6 
 
 
278 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  44.03 
 
 
268 aa  178  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  39.11 
 
 
273 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.85 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  44.57 
 
 
290 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5588  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  42.96 
 
 
272 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  0.729842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  37.08 
 
 
271 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  37.08 
 
 
271 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  39.39 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  35.98 
 
 
270 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  37.79 
 
 
267 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  37.08 
 
 
271 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1954  Cof-like hydrolase  40.08 
 
 
274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  42.91 
 
 
264 aa  163  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  39.33 
 
 
272 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  36.74 
 
 
273 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  38.35 
 
 
277 aa  151  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.86 
 
 
272 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.78 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  38.08 
 
 
281 aa  135  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0277  Cof-like hydrolase  35.91 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0279  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.17 
 
 
308 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.333001  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2937  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  41.04 
 
 
261 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0182848  hitchhiker  0.000402295 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  30.4 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.08 
 
 
269 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  32.05 
 
 
265 aa  106  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.96 
 
 
266 aa  106  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452319  hitchhiker  0.00105022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  33.7 
 
 
268 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  29.92 
 
 
267 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.67 
 
 
274 aa  102  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  33.09 
 
 
273 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  25.71 
 
 
269 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  31.48 
 
 
273 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  27.68 
 
 
274 aa  95.9  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0299  Cof-like hydrolase  31.58 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0141  Cof-like hydrolase  31.11 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  32.04 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2460  HAD superfamily hydrolase  27.38 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00284871  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  27.54 
 
 
269 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.54 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  27.54 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  27.54 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  27.54 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  27.54 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.54 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  24.18 
 
 
277 aa  89.7  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.54 
 
 
269 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2525  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.76 
 
 
257 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000564566  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  29.24 
 
 
270 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  25.9 
 
 
257 aa  89  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2261  HAD superfamily hydrolase  27.57 
 
 
257 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.839309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2426  HAD superfamily hydrolase  27.57 
 
 
257 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0175  HAD family hydrolase  31.39 
 
 
282 aa  89  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  25.54 
 
 
257 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  27.11 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.54 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2444  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.57 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.385743 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  25.54 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.17 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  25.54 
 
 
257 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  25.61 
 
 
266 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.54 
 
 
257 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  24.54 
 
 
273 aa  87  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  29.51 
 
 
272 aa  87  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  25.54 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  25.54 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  25.54 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.54 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  31.29 
 
 
272 aa  85.9  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  28.42 
 
 
273 aa  85.5  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  22.91 
 
 
277 aa  85.5  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  24.91 
 
 
266 aa  85.5  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  26.81 
 
 
269 aa  85.5  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0380  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.71 
 
 
295 aa  85.5  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.890791 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  27.04 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  25.64 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1162  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.18 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.352736  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  30.51 
 
 
267 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.15 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  25.98 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  29.63 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  27.96 
 
 
276 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0615  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.74 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  28.32 
 
 
268 aa  84  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  25.76 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  28.09 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  27.41 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  28.04 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  27.6 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  28.47 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  24.81 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  27.96 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  29.13 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>