More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0293 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  100 
 
 
268 aa  526  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  78.68 
 
 
264 aa  378  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  49.43 
 
 
265 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  47.04 
 
 
285 aa  203  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  48.87 
 
 
264 aa  203  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  44.4 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  46.59 
 
 
269 aa  194  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  43.43 
 
 
273 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  43.82 
 
 
267 aa  192  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  44.69 
 
 
278 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  41.04 
 
 
271 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  41.04 
 
 
271 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  41.42 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  44.03 
 
 
265 aa  178  9e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  41.76 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  45.42 
 
 
290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  46.46 
 
 
281 aa  171  9e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  42.38 
 
 
273 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  41.67 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  39.21 
 
 
277 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  41.44 
 
 
272 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1954  Cof-like hydrolase  41.92 
 
 
274 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0560  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.31 
 
 
265 aa  159  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5588  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  40.07 
 
 
272 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  0.729842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0277  Cof-like hydrolase  40.74 
 
 
259 aa  145  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.27 
 
 
272 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  37.69 
 
 
268 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.13 
 
 
282 aa  138  8.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0505  Cof-like hydrolase  42.81 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  36.69 
 
 
273 aa  129  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  38.43 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  34.19 
 
 
277 aa  125  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0279  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.73 
 
 
308 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.333001  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2937  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  40.61 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0182848  hitchhiker  0.000402295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  36.75 
 
 
271 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
272 aa  108  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  32.95 
 
 
265 aa  108  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  32.7 
 
 
268 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.07 
 
 
275 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.616457 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.96 
 
 
266 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452319  hitchhiker  0.00105022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.7 
 
 
265 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  25.91 
 
 
269 aa  105  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.95 
 
 
274 aa  105  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  27.21 
 
 
276 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.71 
 
 
269 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0141  Cof-like hydrolase  31.64 
 
 
284 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.71 
 
 
269 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  28.68 
 
 
273 aa  102  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  26.35 
 
 
269 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  26.35 
 
 
269 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  26.35 
 
 
269 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.35 
 
 
269 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  26.35 
 
 
269 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  26.35 
 
 
269 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  27.47 
 
 
276 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.35 
 
 
269 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  27.01 
 
 
269 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  28.11 
 
 
269 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  30.68 
 
 
262 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2883  Cof-like hydrolase  31.29 
 
 
282 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  28.94 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  26.59 
 
 
277 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0615  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.11 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  29.28 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  30.22 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  26.59 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  26.97 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  27.08 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  28.62 
 
 
286 aa  97.1  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2460  HAD superfamily hydrolase  28.68 
 
 
257 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00284871  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  30.14 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0299  Cof-like hydrolase  31.85 
 
 
259 aa  96.3  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  29.28 
 
 
267 aa  95.9  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.81 
 
 
271 aa  95.5  7e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.86 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.454773 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  26.81 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  26.81 
 
 
271 aa  94  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  29.75 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2525  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.97 
 
 
257 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000564566  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2261  HAD superfamily hydrolase  28.36 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.839309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2444  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.36 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.385743 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2426  HAD superfamily hydrolase  28.36 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01730  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.99 
 
 
311 aa  92.8  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  27.51 
 
 
273 aa  92.8  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  25.27 
 
 
273 aa  92  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.03 
 
 
269 aa  92  9e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  31 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  27.76 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.97 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.324919  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  26.05 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1895  HAD superfamily hydrolase  29.09 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000132103  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2024  Cof-like hydrolase  28.47 
 
 
281 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0783  HAD superfamily hydrolase  24.26 
 
 
269 aa  89.4  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  27.57 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3044  HAD family hydrolase  27.88 
 
 
273 aa  89  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  26.69 
 
 
280 aa  89  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  26.57 
 
 
279 aa  89  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  31.82 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0380  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.81 
 
 
295 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.890791 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  26.04 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>