More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01700 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_01700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 		 275 aa  543  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.616457 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  53.49 
 
 		 266 aa  252  5.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452319  hitchhiker  0.00105022 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  53.49 
 
 		 269 aa  251  1e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0299  Cof-like hydrolase  52.33 
 
 		 259 aa  247  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0141  Cof-like hydrolase  52.49 
 
 		 284 aa  246  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  52.67 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  49.23 
 
 		 274 aa  238  5e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0380  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  50.78 
 
 		 295 aa  238  6.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.890791 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01730  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  45.35 
 
 		 311 aa  222  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  44.53 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.324919  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0175  HAD family hydrolase  44.07 
 
 		 282 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  40 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.454773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.08 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00675343  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  33.21 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  35.06 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  34.07 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  34.07 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  34.43 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  34.07 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  34.07 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  32.72 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  35.36 
 
 		 264 aa  99  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  25.99 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0607  Cof-like hydrolase  33.21 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000496024  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.36 
 
 		 278 aa  95.1  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  33.45 
 
 		 273 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  33.21 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  34.7 
 
 		 264 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  31.05 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  26.33 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  26.33 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  30.57 
 
 		 272 aa  89  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  31.32 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  30.8 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.61 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl513  HAD-superfamily cof-like hydrolase  25.27 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  31.02 
 
 		 269 aa  85.9  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  28.98 
 
 		 268 aa  85.5  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  24.38 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  25.93 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  28.72 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0986  hypothetical protein  30.18 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.55 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0732  Cof-like hydrolase  25.57 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  26.79 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  24.45 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.46 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  25.89 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0138  Cof-like hydrolase  28.83 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0213598  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  25.72 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0900  Cof-like hydrolase  28.52 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.183998  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.14 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1954  Cof-like hydrolase  31.85 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  28.32 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.71 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  28.89 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  24.63 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0120  Cof-like hydrolase  29.12 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0258  Cof-like hydrolase  22.51 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000345946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.71 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1845  HAD superfamily hydrolase  25.28 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  26.88 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  26.88 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1509  HAD superfamily hydrolase  25.75 
 
 		 271 aa  72  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1097  HAD superfamily hydrolase  24.81 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000207763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  25.38 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  28.78 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl614  HAD-superfamily cof-like hydrolase  25.17 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  25.36 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  25.18 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  27.14 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0217  Cof-like hydrolase  23.9 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  21.94 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  22.18 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  28.07 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  25.38 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  25.36 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  25.36 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  26.01 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  25.36 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.36 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  25.36 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  25.98 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  25.9 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1083  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.36 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  24.62 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  23.22 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  29.96 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  27.5 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.46 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  27.68 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0374  HAD superfamily hydrolase  27.86 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0519666  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1895  HAD superfamily hydrolase  25.8 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000132103  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  24.62 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  24.62 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  24.62 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  24.62 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>