More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0986 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0986  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0120  Cof-like hydrolase  55.26 
 
 
274 aa  291  8e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0934  phosphotransferase  42.65 
 
 
286 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.600795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0911  phosphotransferase  42.28 
 
 
286 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0879  phosphotransferase  42.28 
 
 
286 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0820  phosphotransferase  42.28 
 
 
286 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0848  phosphotransferase  42.28 
 
 
286 aa  208  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  42.12 
 
 
272 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  40.81 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  39.19 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2876  Cof-like hydrolase  40.81 
 
 
272 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2896  phosphotransferase  40.81 
 
 
272 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0306419  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  40.07 
 
 
272 aa  196  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0820  phosphotransferase  40.81 
 
 
272 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  40.44 
 
 
272 aa  195  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  40.44 
 
 
306 aa  195  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  38.83 
 
 
273 aa  194  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  38.83 
 
 
273 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  40.22 
 
 
273 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1306  phosphotransferase  37.09 
 
 
274 aa  185  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1180  phosphotransferase  37.63 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2879  phosphotransferase  36.23 
 
 
273 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  37.5 
 
 
273 aa  169  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  36.92 
 
 
273 aa  168  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  34.48 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  34.1 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  34.1 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  28.26 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  29.35 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  28.26 
 
 
276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  32.86 
 
 
271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  29.14 
 
 
269 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  27.9 
 
 
268 aa  109  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  28.67 
 
 
272 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1451  Cof-like hydrolase  28.19 
 
 
276 aa  105  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  29.03 
 
 
273 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  30.71 
 
 
273 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0607  Cof-like hydrolase  31.9 
 
 
271 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000496024  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  28.06 
 
 
270 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  23.32 
 
 
277 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  22.97 
 
 
277 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1119  Cof-like hydrolase  34.51 
 
 
271 aa  99.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.78603  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  26.94 
 
 
267 aa  99.8  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  27.4 
 
 
268 aa  99.8  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  28.11 
 
 
273 aa  98.6  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  28.21 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  27.54 
 
 
267 aa  96.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  28.72 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  29.89 
 
 
268 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  29.13 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  26.71 
 
 
269 aa  95.9  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  28.99 
 
 
286 aa  95.9  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0138  Cof-like hydrolase  27.57 
 
 
279 aa  94.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0213598  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  28 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1752  HAD family hydrolase  30.04 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00695054  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  28 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  25.36 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  23.75 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  28.36 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  27.11 
 
 
273 aa  93.6  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  27.64 
 
 
270 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  30.53 
 
 
265 aa  92.4  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  24.82 
 
 
266 aa  92  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  27.17 
 
 
273 aa  92  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  24.46 
 
 
266 aa  92  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  28.42 
 
 
281 aa  92  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  28.16 
 
 
270 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  28.42 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0900  Cof-like hydrolase  27.6 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.183998  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  27.82 
 
 
274 aa  90.5  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  27.7 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  28.62 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  27.93 
 
 
281 aa  90.1  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  26.57 
 
 
269 aa  90.1  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  28.62 
 
 
269 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  27.27 
 
 
281 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  27.8 
 
 
266 aa  90.1  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  28.62 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  24.45 
 
 
274 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  27.27 
 
 
281 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.57 
 
 
269 aa  89  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  27.8 
 
 
281 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.57 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  26.57 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  27.01 
 
 
279 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  26.57 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  26.57 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  28.42 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  26.57 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  26.57 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2434  Cof protein  28.14 
 
 
282 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  25.63 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.57 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3223  Cof-like hydrolase  25.98 
 
 
273 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  27.17 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  26.64 
 
 
271 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  27.17 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  27.17 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  27.17 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  27.17 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>