More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0900 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0900  Cof-like hydrolase  100 
 
 
270 aa  555  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.183998  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  36.26 
 
 
274 aa  171  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  36.26 
 
 
274 aa  171  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  37.74 
 
 
270 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  38.81 
 
 
269 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  37.97 
 
 
269 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  37.97 
 
 
269 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  37.97 
 
 
269 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  37.97 
 
 
269 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.97 
 
 
269 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.97 
 
 
269 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.59 
 
 
269 aa  168  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  38.2 
 
 
269 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.36 
 
 
269 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  36.98 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  38.32 
 
 
268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  35.9 
 
 
273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  35.79 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1895  HAD superfamily hydrolase  33.21 
 
 
278 aa  162  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000132103  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0374  HAD superfamily hydrolase  35.19 
 
 
270 aa  159  6e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0519666  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0165  HAD hydrolase, IIB family  28.93 
 
 
293 aa  105  8e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  30.4 
 
 
267 aa  104  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  28.62 
 
 
274 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  29.03 
 
 
274 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  30.25 
 
 
272 aa  100  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  29.6 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  28.09 
 
 
268 aa  95.5  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2024  Cof-like hydrolase  29.23 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  28.79 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf242  COF family HAD hydrolase protein  28.1 
 
 
318 aa  92.8  5e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00196152  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  27.5 
 
 
281 aa  92.8  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  30.43 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0986  hypothetical protein  27.6 
 
 
273 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl614  HAD-superfamily cof-like hydrolase  28.93 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  28.47 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  25.99 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  27.04 
 
 
266 aa  89.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  27.8 
 
 
273 aa  89.7  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  27.74 
 
 
279 aa  89.4  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  30.6 
 
 
271 aa  89  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  29.14 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  27.74 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  27.4 
 
 
273 aa  87  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  28.98 
 
 
271 aa  87  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  29.35 
 
 
273 aa  86.3  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0120  Cof-like hydrolase  28.62 
 
 
274 aa  85.9  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  27.4 
 
 
279 aa  85.9  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  24.64 
 
 
268 aa  85.5  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  28.32 
 
 
270 aa  85.5  9e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.41 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  25.35 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  28.42 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  28.42 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  28.42 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  27.84 
 
 
268 aa  84  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  28.41 
 
 
265 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  28.01 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  30.07 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2525  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.38 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000564566  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  30.07 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  30.07 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  27.61 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  27.37 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  27.11 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  26.67 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.87 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  26.43 
 
 
274 aa  82  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2666  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.13 
 
 
283 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.968723  normal  0.0125888 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 
283 aa  82  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.78 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  25.78 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  25.78 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  26.2 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  27.44 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  25.9 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  27.07 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2261  HAD superfamily hydrolase  24.62 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.839309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  26.41 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  25.78 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2426  HAD superfamily hydrolase  24.62 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  27.44 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  28.83 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.67 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.38 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0156  Cof-like hydrolase  27.44 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0210  HAD superfamily hydrolase  26.67 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  27.21 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  26.97 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  25.82 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.84 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  26.55 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1689  Cof family protein  26.57 
 
 
461 aa  80.1  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00487865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  25.82 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2702  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.89 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0231  Cof-like hydrolase  24.82 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1509  HAD superfamily hydrolase  26.52 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  25.45 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>