More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0279 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0279  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 		 308 aa  596  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.333001  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  45.96 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  45.59 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  39.19 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.15 
 
 		 267 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.97 
 
 		 278 aa  136  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  37.55 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  38.01 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  37.55 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1954  Cof-like hydrolase  37.19 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  37.73 
 
 		 268 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  35.53 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  37.73 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  36.59 
 
 		 281 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.17 
 
 		 265 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  35.13 
 
 		 271 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  35.13 
 
 		 271 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  35.13 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.84 
 
 		 282 aa  115  7.999999999999999e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.09 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  35.16 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  33.81 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  35.36 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  34.78 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  35.61 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  33.95 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5588  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  32.73 
 
 		 272 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  0.729842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  33.57 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0505  Cof-like hydrolase  36.79 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0560  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.25 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  27.04 
 
 		 267 aa  92.4  8e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.45 
 
 		 272 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  31.67 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  31.34 
 
 		 265 aa  85.9  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  26.92 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  31.9 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  27.54 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  24.82 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  24.64 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  24.13 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  27.44 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0277  Cof-like hydrolase  31.95 
 
 		 259 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  30.96 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1811  Cof-like hydrolase  26.12 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2460  HAD superfamily hydrolase  23.3 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00284871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2024  Cof-like hydrolase  30.14 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  26.86 
 
 		 265 aa  79  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  25.27 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2937  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  31.71 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0182848  hitchhiker  0.000402295 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2525  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.88 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000564566  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  21.71 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0615  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.66 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2444  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.25 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.385743 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2261  HAD superfamily hydrolase  24.25 
 
 		 257 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.839309  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  24.82 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2426  HAD superfamily hydrolase  24.25 
 
 		 257 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  26.55 
 
 		 262 aa  75.5  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  25.26 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  29.68 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1162  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.74 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.352736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  26.83 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  26.74 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  26.74 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  26.74 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.74 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.37 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1306  phosphotransferase  26.12 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  23.79 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  26.74 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0217  Cof-like hydrolase  24.1 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  30.6 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0817  HAD family hydrolase  24.65 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  23.45 
 
 		 279 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  24.91 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2677  Cof-like hydrolase  26.46 
 
 		 257 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00196441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.03 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  29.45 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  28.11 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  27.59 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  27.17 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  25.28 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  27.59 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  27.59 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  26.02 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  27.59 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.59 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  25.37 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.59 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  23.64 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  27.27 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  27.97 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  26.02 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0783  HAD superfamily hydrolase  24.73 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  27.24 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.02 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  25.28 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  26.52 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0879  phosphotransferase  24.91 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  25.55 
 
 		 266 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>