More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0277 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0277  Cof-like hydrolase  100 
 
 
259 aa  520  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  43.45 
 
 
278 aa  196  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  43.87 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  42.16 
 
 
270 aa  192  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  42.91 
 
 
267 aa  191  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  40.6 
 
 
271 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  40.6 
 
 
271 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  40.6 
 
 
271 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  40.07 
 
 
273 aa  176  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  39.62 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  40 
 
 
268 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  36.67 
 
 
277 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  37.45 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  39.85 
 
 
264 aa  145  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.29 
 
 
290 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  37.02 
 
 
265 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  39.77 
 
 
264 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.78 
 
 
282 aa  135  8e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1954  Cof-like hydrolase  37.88 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  37.26 
 
 
272 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.36 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.4 
 
 
272 aa  128  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  34.73 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.91 
 
 
265 aa  125  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  37.45 
 
 
269 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  34.73 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  34.91 
 
 
271 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5588  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  35.64 
 
 
272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  0.729842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.85 
 
 
261 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00675343  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0560  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.32 
 
 
265 aa  105  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2937  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  36.16 
 
 
261 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0182848  hitchhiker  0.000402295 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.07 
 
 
266 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452319  hitchhiker  0.00105022 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  28.88 
 
 
276 aa  95.9  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2883  Cof-like hydrolase  32.62 
 
 
282 aa  95.9  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0505  Cof-like hydrolase  36.75 
 
 
303 aa  95.5  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  28.77 
 
 
273 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  28.52 
 
 
281 aa  93.2  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  31.52 
 
 
273 aa  92.8  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  28.42 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  29.6 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  30.43 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  27.88 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  30.6 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  28.36 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  30.25 
 
 
265 aa  89  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0279  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.95 
 
 
308 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.333001  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0205  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
292 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.855458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.99 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  31.16 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  29.14 
 
 
273 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  28.08 
 
 
267 aa  87  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  26.84 
 
 
273 aa  87  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  30.74 
 
 
268 aa  86.3  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  29.2 
 
 
259 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  25.8 
 
 
289 aa  85.9  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  25.8 
 
 
289 aa  85.9  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2024  Cof-like hydrolase  27.97 
 
 
281 aa  85.5  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  27.11 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  28.52 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  30.86 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  28.36 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  25.29 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  31.7 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  31.28 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  32.26 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  27.78 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  27.78 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.78 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  27.78 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  27.78 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  27.78 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.78 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  27.37 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.11 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  29.39 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  25.52 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.24 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  27.31 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  30.11 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  24.81 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  25.95 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.95 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  25.95 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  25.95 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  25.95 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  27.18 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  29.7 
 
 
265 aa  82  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  30.45 
 
 
273 aa  82  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  27.96 
 
 
267 aa  82  0.000000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  27.31 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  29.39 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.31 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.31 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  27.11 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  29.03 
 
 
269 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  29.03 
 
 
269 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  26.64 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.31 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  26.6 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  25.98 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>