More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5035 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  100 
 
 
273 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  91.94 
 
 
273 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  50.19 
 
 
268 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0279  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  45.59 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.333001  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  39.25 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.18 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  38.43 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  37.93 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  37.55 
 
 
267 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  36.53 
 
 
270 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.74 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  35.38 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  34.93 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1954  Cof-like hydrolase  36.86 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  36.63 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  36.63 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  34.07 
 
 
265 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  36.26 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  34.4 
 
 
269 aa  112  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  35.61 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  34.31 
 
 
273 aa  102  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.09 
 
 
265 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  35.64 
 
 
277 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  32.58 
 
 
265 aa  98.6  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  33.7 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.67 
 
 
282 aa  94  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  25 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  30.07 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  31.39 
 
 
268 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.21 
 
 
290 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  27.87 
 
 
266 aa  89  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0560  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.08 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  27.18 
 
 
266 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  30 
 
 
273 aa  86.3  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2460  HAD superfamily hydrolase  27.31 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00284871  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  29.93 
 
 
281 aa  85.9  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.91 
 
 
272 aa  85.9  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2525  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.68 
 
 
257 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000564566  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  29.04 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  29.07 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  24.26 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  23.99 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  23.99 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  23.74 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  29.21 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  29.67 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  28.87 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  25.35 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  26.98 
 
 
269 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  29.59 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0505  Cof-like hydrolase  46.55 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  28.42 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  25.8 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  32.86 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  23.47 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  24.37 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  26.18 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2261  HAD superfamily hydrolase  26.94 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.839309  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl513  HAD-superfamily cof-like hydrolase  24.91 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2426  HAD superfamily hydrolase  26.94 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2444  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.94 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.385743 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  24.01 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  26.84 
 
 
268 aa  79  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  29.18 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  28.67 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  28.67 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf524  COF family HAD hydrolase protein  22.88 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  28.67 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  27.89 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  28.67 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  29.39 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  28.67 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  30.15 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  30.15 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  28.67 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  28.21 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  29.18 
 
 
281 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  26.88 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  28.16 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  28.16 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.09 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  27.57 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  28.36 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0277  Cof-like hydrolase  31.16 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  23.1 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  29.32 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  28.03 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2937  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  30.63 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0182848  hitchhiker  0.000402295 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  26.55 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  26.95 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  26.09 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  25.45 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  25.45 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  25.45 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.45 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.45 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  28.03 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  29.32 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  29.32 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  29.32 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>