More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002120 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  100 
 
 		 274 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  85.4 
 
 		 270 aa  488  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  72.46 
 
 		 275 aa  422  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  66.54 
 
 		 265 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  54.37 
 
 		 266 aa  315  5e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  52.27 
 
 		 269 aa  293  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  52.27 
 
 		 269 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  52.27 
 
 		 269 aa  292  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  51.52 
 
 		 266 aa  287  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  53.08 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  52.65 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  52.27 
 
 		 266 aa  285  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  53.46 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  51.72 
 
 		 266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  51.72 
 
 		 266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  51.72 
 
 		 266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  51.72 
 
 		 266 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.152006 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  51.34 
 
 		 266 aa  280  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  51.34 
 
 		 266 aa  280  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  51.34 
 
 		 266 aa  280  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  51.34 
 
 		 266 aa  280  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  51.34 
 
 		 266 aa  280  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  48.68 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2727  Cof-like hydrolase  40.38 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  39.78 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  39.92 
 
 		 274 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  39.92 
 
 		 274 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  39.92 
 
 		 274 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  39.78 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  40.3 
 
 		 273 aa  202  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  40.3 
 
 		 273 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  40.3 
 
 		 273 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  40.3 
 
 		 273 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  40.3 
 
 		 273 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  40.3 
 
 		 273 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  40.3 
 
 		 273 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  38.4 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  39.77 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  39.77 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  38.78 
 
 		 273 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  39.16 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  38.4 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  38.31 
 
 		 272 aa  195  5.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  37.45 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3044  HAD family hydrolase  38.64 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3083  HAD family hydrolase  38.26 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3225  Cof-like hydrolase  38.26 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0534  hydrolase Cof  36.26 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  36.26 
 
 		 272 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  36.26 
 
 		 272 aa  181  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  36.26 
 
 		 272 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  36.26 
 
 		 272 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  36.26 
 
 		 272 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  36.26 
 
 		 272 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  36.26 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3291  Cof-like hydrolase  36.74 
 
 		 263 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  35.11 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  36.94 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  35.09 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  35.09 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  35.09 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  35.09 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  34.72 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  34.1 
 
 		 266 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3169  Cof-like hydrolase  36.02 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0156  Cof-like hydrolase  32.45 
 
 		 269 aa  135  9e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0069  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.8 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.707164  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  26.64 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  31.84 
 
 		 267 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  26.69 
 
 		 262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  29.56 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  29.39 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  27.11 
 
 		 269 aa  105  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.24 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0427  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.15 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.635472  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.84 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  27.84 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.45 
 
 		 273 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  26.2 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  25.91 
 
 		 268 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  28.93 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  27.84 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  27.84 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  27.84 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  27.84 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  28.12 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  27.34 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.84 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0820  phosphotransferase  30.32 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  29.39 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0911  phosphotransferase  30.32 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  29.71 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0848  phosphotransferase  29.35 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0879  phosphotransferase  30.32 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2876  Cof-like hydrolase  29.14 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2896  phosphotransferase  29.14 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0306419  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0820  phosphotransferase  29.14 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  29.39 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  29.39 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0934  phosphotransferase  29.96 
 
 		 286 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.600795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>