More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0540 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0540  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
277 aa  562  1.0000000000000001e-159  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.467254  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  38.15 
 
 
275 aa  172  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  33.58 
 
 
267 aa  131  9e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  30.11 
 
 
266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  27.01 
 
 
266 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  27.37 
 
 
266 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  28.06 
 
 
265 aa  105  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  30.69 
 
 
270 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  31.65 
 
 
270 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  30.5 
 
 
273 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  29.41 
 
 
271 aa  103  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  29.93 
 
 
265 aa  102  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  30.07 
 
 
270 aa  102  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  30.94 
 
 
270 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  30.94 
 
 
270 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  30.94 
 
 
270 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  31.41 
 
 
281 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  30.94 
 
 
270 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  30.94 
 
 
270 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  30.94 
 
 
270 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  29.08 
 
 
273 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  27.37 
 
 
266 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  29.04 
 
 
271 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  30.43 
 
 
281 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1298  HAD superfamily hydrolase  31 
 
 
286 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000863241  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  29.74 
 
 
268 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  30.58 
 
 
270 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  30.58 
 
 
270 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  30.07 
 
 
281 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  28.1 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  28.1 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.152006 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  28.1 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  28.1 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  26.84 
 
 
269 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  26.84 
 
 
269 aa  97.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  29.48 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  27.74 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  27.74 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  27.74 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  27.74 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  29.15 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  30.8 
 
 
271 aa  96.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  26.47 
 
 
269 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  27.74 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  30.25 
 
 
272 aa  95.9  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  30.04 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  27.94 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  23.76 
 
 
265 aa  94  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  30.55 
 
 
269 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  27.74 
 
 
266 aa  94  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  28.42 
 
 
274 aa  94  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  27.67 
 
 
266 aa  93.6  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  30.55 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  30.55 
 
 
269 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  28.78 
 
 
267 aa  92.4  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  30.51 
 
 
273 aa  92.4  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  28.01 
 
 
271 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  29.15 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  29.82 
 
 
269 aa  91.3  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1225  HAD superfamily hydrolase  28.21 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  28.31 
 
 
268 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  29.82 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  28.78 
 
 
271 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  25.55 
 
 
278 aa  89.4  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  26.94 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  26.26 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  30.25 
 
 
279 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3074  Cof-like hydrolase  28.41 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0231  Cof-like hydrolase  27.8 
 
 
273 aa  87.8  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0795  Cof-like hydrolase  26.07 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  28.67 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1845  HAD superfamily hydrolase  29.54 
 
 
269 aa  87.4  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  27.54 
 
 
244 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl503  HAD-superfamily cof-like hydrolase  27.86 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  28.52 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0762  Cof-like hydrolase  28.47 
 
 
277 aa  85.9  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  28.26 
 
 
259 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  27.64 
 
 
244 aa  85.5  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  27.46 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  28.04 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0217  Cof-like hydrolase  26.52 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  27.24 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  26.37 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1176  HAD superfamily hydrolase  31.21 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.534777  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  28.21 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  29.14 
 
 
286 aa  84  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  28.92 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  27.47 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  31.05 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  27.7 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1081  Cof-like hydrolase  31.14 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00468672  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  26.28 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  27.48 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  24.2 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  29.58 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1851  Cof-like hydrolase  28.32 
 
 
274 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  25.35 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1016  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.76 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.650618  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  26.09 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  27.56 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>