More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2813 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2813  Cof protein  100 
 
 
278 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2353  Cof-like hydrolase  42.42 
 
 
273 aa  217  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2352  Cof-like hydrolase  39.93 
 
 
292 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  40.67 
 
 
270 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6319  putative Cof hydrolase  41.89 
 
 
270 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171761  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  40.46 
 
 
272 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0457  Cof-like hydrolase  39.78 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  40.84 
 
 
270 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7133  Cof-like hydrolase  41.06 
 
 
266 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  38.55 
 
 
267 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3274  Cof protein  39.41 
 
 
267 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1274  Cof-like hydrolase  40.07 
 
 
272 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442966  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3464  Cof-like hydrolase  38.93 
 
 
267 aa  185  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3772  Cof-like hydrolase  38.17 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3771  Cof-like hydrolase  38.87 
 
 
273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.540107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  36.02 
 
 
270 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6359  Cof-like hydrolase  39.31 
 
 
271 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.164075 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  35 
 
 
272 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  34.59 
 
 
269 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  34.17 
 
 
269 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  31.16 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  28.9 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  28.46 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  30.69 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  30.29 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  28.31 
 
 
273 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  29.74 
 
 
277 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  24 
 
 
267 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  28.26 
 
 
270 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  28.31 
 
 
272 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  28.15 
 
 
266 aa  99.4  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  26.45 
 
 
268 aa  99  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  25.87 
 
 
283 aa  99  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  27.31 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  27.17 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  30.6 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  28.79 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  27.05 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  26.98 
 
 
262 aa  96.3  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  24.9 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2666  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.57 
 
 
283 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.968723  normal  0.0125888 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  25.52 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  25.52 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.52 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  25.94 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  28.16 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  25.52 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  27.74 
 
 
273 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  28.78 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  25.17 
 
 
283 aa  92.4  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  27.6 
 
 
281 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  27.6 
 
 
281 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  27.6 
 
 
281 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  24.13 
 
 
284 aa  92  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  25.52 
 
 
283 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1119  Cof-like hydrolase  28.68 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.78603  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  27.6 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.22 
 
 
283 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  27.6 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  23.47 
 
 
266 aa  90.5  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  26.28 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  26.09 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  25.37 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  27.67 
 
 
273 aa  90.1  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  26.57 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4533  hypothetical protein  28.62 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.125216  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0457  Cof-like hydrolase  26.04 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  25.8 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  24.3 
 
 
279 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  25.27 
 
 
268 aa  87  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2702  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.92 
 
 
283 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  26.69 
 
 
273 aa  86.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  26.89 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4607  hypothetical protein  27.17 
 
 
287 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.356417  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  26.69 
 
 
273 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  25 
 
 
273 aa  85.5  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  26.69 
 
 
273 aa  85.5  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  26.69 
 
 
273 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  26.69 
 
 
273 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.69 
 
 
273 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1176  HAD superfamily hydrolase  29.32 
 
 
271 aa  85.9  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.534777  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  27.6 
 
 
270 aa  85.5  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  29.52 
 
 
267 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  26.74 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  25.27 
 
 
269 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  25.27 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  23.24 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  25.18 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.67 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  26.18 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3074  Cof-like hydrolase  26.92 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  24.91 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  27.54 
 
 
269 aa  84  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  24.81 
 
 
268 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.57 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  27.68 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0210  HAD superfamily hydrolase  23.89 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0247  HAD superfamily hydrolase  23.64 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  25.81 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  25.81 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>