More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1653 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1653  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  833    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  36.19 
 
 
275 aa  159  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.7 
 
 
273 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  34.7 
 
 
273 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  34.7 
 
 
273 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  34.7 
 
 
273 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  34.7 
 
 
273 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  34.19 
 
 
273 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.7 
 
 
273 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.7 
 
 
273 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.33 
 
 
273 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  34.33 
 
 
273 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  33.58 
 
 
273 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  29.04 
 
 
270 aa  127  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0795  Cof-like hydrolase  29.7 
 
 
269 aa  126  7e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1225  HAD superfamily hydrolase  29.85 
 
 
266 aa  126  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  31.2 
 
 
267 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  31.2 
 
 
267 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  31.97 
 
 
268 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  28.52 
 
 
268 aa  119  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  29.52 
 
 
265 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  28.95 
 
 
268 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  29.32 
 
 
269 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1728  Cof-like hydrolase  32.21 
 
 
268 aa  116  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  29.17 
 
 
268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  28.32 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  29.78 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0217  Cof-like hydrolase  26.81 
 
 
269 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  30.97 
 
 
266 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  28.25 
 
 
271 aa  113  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  31.84 
 
 
268 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  27.88 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  27.88 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  27.88 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  27.88 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  27.88 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  30.97 
 
 
266 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  27.88 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  31 
 
 
268 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  27.51 
 
 
281 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  27.51 
 
 
281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  29.41 
 
 
280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  29.5 
 
 
272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  29.09 
 
 
269 aa  110  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  27.51 
 
 
281 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 
138 aa  109  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  45.53 
 
 
139 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  27.88 
 
 
270 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  30.37 
 
 
269 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  27.88 
 
 
270 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  27.14 
 
 
270 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1176  HAD superfamily hydrolase  27.57 
 
 
271 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.534777  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  27.14 
 
 
270 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  28.62 
 
 
272 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  30.18 
 
 
271 aa  107  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  41.48 
 
 
134 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1024  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 
147 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  27.88 
 
 
270 aa  107  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  44.44 
 
 
145 aa  106  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  27.14 
 
 
269 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  28.04 
 
 
273 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  40.3 
 
 
145 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  27.88 
 
 
271 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  27.88 
 
 
271 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  31.11 
 
 
268 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  26.77 
 
 
269 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1757  hypothetical protein  41.61 
 
 
144 aa  103  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  26.18 
 
 
281 aa  103  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  40.77 
 
 
143 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  44.09 
 
 
144 aa  103  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  30.07 
 
 
274 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  26.39 
 
 
269 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  45.19 
 
 
136 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  45.19 
 
 
136 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  45.19 
 
 
136 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  45.19 
 
 
136 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  28.94 
 
 
267 aa  101  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  39.39 
 
 
142 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  45.19 
 
 
136 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  45.19 
 
 
136 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  45.19 
 
 
136 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  45.19 
 
 
136 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  26.45 
 
 
273 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1097  HAD superfamily hydrolase  30.15 
 
 
273 aa  100  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000207763  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  44.26 
 
 
139 aa  100  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  29.18 
 
 
274 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1031  thioesterase family protein  39.42 
 
 
146 aa  100  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  42.54 
 
 
138 aa  100  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  39.1 
 
 
140 aa  99.8  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1161  thioesterase  39.42 
 
 
157 aa  99.8  8e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  28.46 
 
 
270 aa  99.4  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03576  esterase YdiI  40.44 
 
 
142 aa  98.2  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.653311  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1478  hypothetical protein  43.28 
 
 
136 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301889  hitchhiker  0.0000119819 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  42.54 
 
 
138 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  45.86 
 
 
136 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  39.26 
 
 
140 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  26.67 
 
 
279 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1977  hypothetical protein  43.28 
 
 
136 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333806 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1806  hypothetical protein  43.28 
 
 
136 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0972306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1497  hypothetical protein  43.28 
 
 
136 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00047246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>