More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0908 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0908  sugar phosphatase SupH  100 
 
 
176 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  90.34 
 
 
271 aa  330  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  91.38 
 
 
271 aa  329  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  91.38 
 
 
271 aa  329  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  91.38 
 
 
271 aa  329  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  91.38 
 
 
271 aa  329  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  90.8 
 
 
271 aa  329  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  90.8 
 
 
271 aa  328  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  90.23 
 
 
271 aa  326  9e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  89.66 
 
 
271 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  82.76 
 
 
269 aa  304  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  82.18 
 
 
269 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  82.18 
 
 
269 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  82.18 
 
 
269 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  82.18 
 
 
269 aa  301  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  75.86 
 
 
271 aa  281  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  46.75 
 
 
270 aa  168  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  43.1 
 
 
271 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  43.1 
 
 
271 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  43.1 
 
 
271 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  43.1 
 
 
271 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  43.75 
 
 
271 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  43.75 
 
 
271 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  43.75 
 
 
271 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  42.53 
 
 
271 aa  151  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  42.53 
 
 
271 aa  151  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  42.53 
 
 
271 aa  151  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  43.75 
 
 
271 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  43.75 
 
 
271 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  43.1 
 
 
271 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  39.76 
 
 
269 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  42.53 
 
 
271 aa  144  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  39.24 
 
 
263 aa  131  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  37.58 
 
 
262 aa  118  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2548  Cof-like hydrolase  32.32 
 
 
266 aa  97.4  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0286905  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2600  Cof-like hydrolase  32.32 
 
 
266 aa  97.4  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.20198  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2088  HAD superfamily hydrolase  31.9 
 
 
269 aa  94.4  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.656055  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  31.21 
 
 
273 aa  88.6  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  30.77 
 
 
270 aa  85.9  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  35.92 
 
 
265 aa  85.9  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  31.65 
 
 
267 aa  84.7  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  29.7 
 
 
262 aa  77.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  29.7 
 
 
262 aa  77  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0836  HAD superfamily hydrolase  29.7 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.781364  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  29.09 
 
 
270 aa  75.1  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  26.43 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  28.48 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  29.63 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1793  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.75 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324577  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  28.66 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  28.07 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1558  HAD superfamily hydrolase  31.62 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  25.62 
 
 
272 aa  67.4  0.00000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  30.71 
 
 
273 aa  67  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.41 
 
 
273 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3881  Cof-like hydrolase  30.14 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0852167  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3793  HAD superfamily hydrolase  30.82 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.58 
 
 
296 aa  65.5  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00157591  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4072  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.82 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0578925 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3962  HAD superfamily hydrolase  30.82 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3808  HAD superfamily hydrolase  30.82 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0549007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4271  HAD superfamily hydrolase  30.82 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.596112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.57 
 
 
273 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4183  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.33 
 
 
268 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000631727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4119  HAD superfamily hydrolase  30.82 
 
 
268 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
273 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
273 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
273 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
273 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
273 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.57 
 
 
273 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.57 
 
 
273 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1878  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.8 
 
 
270 aa  64.3  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  29.63 
 
 
273 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  29.41 
 
 
264 aa  62.8  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1077  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.45 
 
 
268 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000777546  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0815  HAD superfamily hydrolase  29.11 
 
 
274 aa  62  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.493378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4161  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.45 
 
 
268 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  35.37 
 
 
277 aa  61.6  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0257  hydrolase  43.37 
 
 
240 aa  60.1  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.509124  hitchhiker  0.000575913 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2751  Cof-like hydrolase  29.63 
 
 
272 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.181052  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  39.77 
 
 
263 aa  59.7  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2405  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.79 
 
 
263 aa  59.3  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  35.51 
 
 
256 aa  59.3  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  32.63 
 
 
276 aa  58.9  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  25.44 
 
 
279 aa  58.2  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  28.97 
 
 
268 aa  58.5  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  32.63 
 
 
276 aa  58.2  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  37.5 
 
 
460 aa  57.8  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  30.71 
 
 
274 aa  57.8  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  27.56 
 
 
273 aa  57.4  0.00000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  33.33 
 
 
270 aa  57  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0700  putative HAD superfamily hydrolase  37.18 
 
 
273 aa  56.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1653  hypothetical protein  34.12 
 
 
407 aa  56.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  32.22 
 
 
289 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  30.51 
 
 
266 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  32.22 
 
 
289 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
266 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.58 
 
 
282 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2070  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
269 aa  56.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>