More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0486 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 262 aa  537  9.999999999999999e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  42.25 
 
 		 271 aa  198  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  41.92 
 
 		 263 aa  198  9e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  41.47 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  41.47 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  41.47 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  39.69 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  41.47 
 
 		 271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  41.47 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  41.47 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  39.3 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  39.3 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  39.3 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  39.3 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  39.3 
 
 		 271 aa  195  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  39.3 
 
 		 271 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  39.92 
 
 		 270 aa  195  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  41.09 
 
 		 271 aa  195  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  41.09 
 
 		 271 aa  194  9e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  39.53 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  41.02 
 
 		 269 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  40.7 
 
 		 269 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  40.7 
 
 		 269 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  41.02 
 
 		 269 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  41.02 
 
 		 269 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  41.7 
 
 		 271 aa  186  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  39.3 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  39.3 
 
 		 271 aa  185  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  37.98 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  37.98 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  37.98 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  37.98 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  37.98 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  38.52 
 
 		 265 aa  152  8e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  33.72 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2088  HAD superfamily hydrolase  32.45 
 
 		 269 aa  145  8.000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.656055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2548  Cof-like hydrolase  32.45 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0286905  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2600  Cof-like hydrolase  32.45 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.20198  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  30.94 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1559  HAD superfamily hydrolase  33.46 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.847302  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2070  HAD superfamily hydrolase  34.44 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208936  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  31.95 
 
 		 272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0836  HAD superfamily hydrolase  31.32 
 
 		 273 aa  128  7.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.781364  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  34.33 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  33.58 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0908  sugar phosphatase SupH  37.58 
 
 		 176 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  33.21 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1558  HAD superfamily hydrolase  31.5 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  31.03 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0545  hydrolase  30.15 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0971  HAD family hydrolase  30.22 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0815  HAD superfamily hydrolase  32.1 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.493378  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  30.65 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  31.14 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  30.23 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  30.19 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  29.96 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  28.02 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  28.63 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  29.17 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.97 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  29.21 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  31.9 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.55 
 
 		 281 aa  90.5  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  30.35 
 
 		 265 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  28.62 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2405  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.32 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.76 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2460  HAD superfamily hydrolase  30.08 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00284871  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  24.35 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  25.18 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  25.18 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  40.74 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  25.91 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  27.34 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3240  hydrolase  30.3 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0554089  normal  0.223166 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0436  putative HAD superfamily hydrolase  26.06 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.237165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2261  HAD superfamily hydrolase  29.5 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.839309  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2426  HAD superfamily hydrolase  29.5 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  27.24 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2444  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.5 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.385743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0213  Cof-like hydrolase  27.62 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.78 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  28.78 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  28.78 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  28.78 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  28.78 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.78 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  28.78 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2525  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.74 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000564566  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  29.68 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  28.04 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.78 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  27.31 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0253  HAD superfamily hydrolase  27.27 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  28.42 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.62 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>