More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0062 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
270 aa  559  1e-158  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  38.26 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  36.36 
 
 
264 aa  170  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  31.85 
 
 
269 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  33.72 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  31.11 
 
 
271 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  30.74 
 
 
271 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  30.74 
 
 
271 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  30.74 
 
 
271 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  30.74 
 
 
271 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  30.74 
 
 
271 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  30.74 
 
 
271 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  30.51 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  30.74 
 
 
271 aa  136  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  31.5 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  31.5 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  31.5 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  31.5 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  31.5 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  35.9 
 
 
273 aa  133  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  31.37 
 
 
272 aa  133  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  29.96 
 
 
263 aa  132  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0815  HAD superfamily hydrolase  31.14 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.493378  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
265 aa  126  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  31.32 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  30 
 
 
271 aa  122  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  28.73 
 
 
271 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  28.73 
 
 
271 aa  122  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  28.73 
 
 
271 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  28.73 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  28.73 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  28.73 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  30.22 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  30.57 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  30.22 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  30.22 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  30.22 
 
 
271 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  29.85 
 
 
271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  28.36 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0836  HAD superfamily hydrolase  31.27 
 
 
273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.781364  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  29.85 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0545  hydrolase  29.03 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  31.09 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1558  HAD superfamily hydrolase  28.27 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2600  Cof-like hydrolase  32.13 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.20198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2548  Cof-like hydrolase  32.13 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0286905  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  28.73 
 
 
271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  28.63 
 
 
267 aa  108  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2088  HAD superfamily hydrolase  29.23 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.656055  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  28.36 
 
 
287 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  28.36 
 
 
271 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1559  HAD superfamily hydrolase  28.21 
 
 
268 aa  105  7e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.847302  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  28.25 
 
 
270 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  27.14 
 
 
261 aa  103  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  28.1 
 
 
256 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  30 
 
 
265 aa  102  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2405  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.82 
 
 
263 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  30.37 
 
 
279 aa  99  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0971  HAD family hydrolase  27.99 
 
 
278 aa  98.6  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  27.1 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  30.15 
 
 
263 aa  96.3  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2070  HAD superfamily hydrolase  27.27 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208936  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1793  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.83 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1878  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.28 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  28.98 
 
 
273 aa  86.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.27 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.69 
 
 
468 aa  82  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  28.42 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.83 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  25.19 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  26.76 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  27.76 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  25.84 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  25.84 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  25.84 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  25.84 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.84 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.84 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.11 
 
 
282 aa  79  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0732  Cof-like hydrolase  25.74 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  26.49 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0968  HAD superfamily hydrolase  28.36 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.860573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  26.49 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  26.14 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  25.47 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  26.85 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  26.12 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  24.65 
 
 
269 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  27.24 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.47 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.35 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0210  HAD superfamily hydrolase  26.69 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  25.78 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0250  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.01 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.62 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  26.48 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0246  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.35 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.47 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  26.48 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  26.13 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>