More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0971 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0971  HAD family hydrolase  100 
 
 
278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  32.34 
 
 
273 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  29.85 
 
 
271 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  29.48 
 
 
271 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  29.48 
 
 
271 aa  109  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  29.48 
 
 
271 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2070  HAD superfamily hydrolase  31.39 
 
 
269 aa  109  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208936  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  29.48 
 
 
271 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  29.48 
 
 
271 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  29.48 
 
 
271 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  30.22 
 
 
262 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  29.71 
 
 
270 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0815  HAD superfamily hydrolase  26.86 
 
 
274 aa  102  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.493378  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  27.11 
 
 
269 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0836  HAD superfamily hydrolase  28.36 
 
 
273 aa  101  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.781364  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  27.31 
 
 
272 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  26.79 
 
 
270 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  29.48 
 
 
271 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  29.48 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  27.24 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  27.99 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  27.24 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  28.52 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1558  HAD superfamily hydrolase  29.79 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  26.87 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  26.87 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  26.87 
 
 
271 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  27.55 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  29.06 
 
 
265 aa  94  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  27.55 
 
 
269 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  27.55 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  27.55 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  26.12 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  27.55 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  26.97 
 
 
271 aa  92.4  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  26.59 
 
 
271 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  26.59 
 
 
271 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  26.59 
 
 
271 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  26.59 
 
 
271 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  26.59 
 
 
271 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1559  HAD superfamily hydrolase  26.49 
 
 
268 aa  89.7  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.847302  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  26.59 
 
 
271 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  28.09 
 
 
262 aa  89.4  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  26.37 
 
 
271 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2600  Cof-like hydrolase  28.47 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.20198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2548  Cof-like hydrolase  28.47 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0286905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  26.22 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  27.72 
 
 
262 aa  85.9  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  28.06 
 
 
265 aa  85.5  9e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  29.46 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  27.86 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  28.74 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.74 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1401  Cof-like hydrolase  29.03 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  28.06 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  27.67 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  27.67 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  27.67 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.67 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  27.03 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  26.79 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  26.79 
 
 
271 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  26.79 
 
 
271 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2677  Cof-like hydrolase  28.12 
 
 
257 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00196441  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2088  HAD superfamily hydrolase  26.49 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.656055  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  27.11 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1162  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.27 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.352736  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  28.26 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.59 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0545  hydrolase  25.96 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  28.3 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  28.63 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2067  hydrolase  27.07 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.347224  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2176  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.64 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.685473  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0949  Cof-like hydrolase  27.03 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000135628  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  26.09 
 
 
265 aa  75.5  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  28.11 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  26.81 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  34.65 
 
 
460 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1927  Cof-like hydrolase  23.74 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107628  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  26.56 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  24.91 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  27.88 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  25.2 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  28.07 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  26.37 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  27.92 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  27.92 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  27.92 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  27.92 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  27.92 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.92 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  26.88 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.92 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  26.99 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2161  Cof-like hydrolase  27.01 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3240  hydrolase  26.05 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0554089  normal  0.223166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  27.37 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  27.13 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>