More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0968 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0968  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
268 aa  549  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.860573  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0323  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  49.41 
 
 
466 aa  245  4e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  45.88 
 
 
468 aa  239  4e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1489  Cof-like hydrolase  32.83 
 
 
270 aa  159  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 
260 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0949  Cof-like hydrolase  32.31 
 
 
258 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000135628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  31.62 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.62 
 
 
257 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  31.62 
 
 
257 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  31.62 
 
 
257 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  31.62 
 
 
257 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2677  Cof-like hydrolase  31.18 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00196441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.83 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  31.23 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.23 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1162  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.83 
 
 
257 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.352736  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  30.43 
 
 
257 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0258  Cof-like hydrolase  29.81 
 
 
265 aa  123  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000345946  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0700  putative HAD superfamily hydrolase  28.36 
 
 
273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1870  class II-B haloacid dehalogenase  28.46 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.791968  normal  0.480034 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2159  Cof protein  28.95 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0259  Cof-like hydrolase  28.15 
 
 
261 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000719541  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  29.1 
 
 
265 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  27.76 
 
 
460 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0840  Cof-like hydrolase  29.46 
 
 
273 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.381548 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1689  Cof family protein  27.76 
 
 
461 aa  99.8  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00487865  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0716  HAD family phosphatase  28.3 
 
 
256 aa  99.8  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.1 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0780  hypothetical protein  26.28 
 
 
462 aa  97.8  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.680411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1083  Cof-like hydrolase  27.34 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2176  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.88 
 
 
258 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.685473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2067  hydrolase  27.48 
 
 
258 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.347224  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2161  Cof-like hydrolase  27.24 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3240  hydrolase  27.86 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0554089  normal  0.223166 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1930  HAD family hydrolase  28.9 
 
 
258 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1882  HAD superfamily hydrolase  27.76 
 
 
258 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2077  HAD family hydrolase  28.9 
 
 
258 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  29.96 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  27.51 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1892  HAD superfamily hydrolase  28.52 
 
 
258 aa  90.1  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0394  Cof-like hydrolase  26.29 
 
 
258 aa  89.7  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  29.39 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1927  Cof-like hydrolase  27.1 
 
 
258 aa  86.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107628  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3317  Cof-like hydrolase  27.38 
 
 
256 aa  86.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000026375  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  27.65 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  26.14 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0504  HAD family hydrolase  29.12 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.928419  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1446  Cof-like hydrolase  29 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0492  HAD family hydrolase  28.35 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  26.18 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  25.21 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.21 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.21 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  25.21 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  25.21 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  25.21 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  25.21 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1822  HAD superfamily hydrolase  25.39 
 
 
261 aa  79  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.1 
 
 
273 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  23.68 
 
 
268 aa  79  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  23.6 
 
 
268 aa  79  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  26.71 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.7 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  28.36 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  26.89 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  25.89 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  24.9 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2261  Cof-like hydrolase  27.65 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000564969  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  25.76 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  28.8 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1580  Cof-like hydrolase  25.9 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  26.55 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  26.92 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  23.31 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  26.62 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  25.19 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  25.84 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  24.91 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  24.6 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  24.72 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  25.19 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  24.24 
 
 
281 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  24.06 
 
 
269 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  23.68 
 
 
269 aa  72  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  23.86 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  24.35 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2000  HAD superfamily hydrolase  27.01 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  23.86 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  23.86 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1151  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  23.18 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000018456 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  25 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  25.19 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  25.72 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  23.68 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  23.79 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  25.45 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  24.63 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.39 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  22.85 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0732  Cof-like hydrolase  27.78 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>