More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1251 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  100 
 
 		 256 aa  527  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  34.03 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  34.03 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  35.32 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  34.13 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  34.27 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  31.73 
 
 		 279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  30.8 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  32.53 
 
 		 261 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.68 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  33.2 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2548  Cof-like hydrolase  32.78 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0286905  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2600  Cof-like hydrolase  32.78 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.20198  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2405  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.5 
 
 		 263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  31.67 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  32.4 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  28.98 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  30.58 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  27.92 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  27.92 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  27.92 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  27.92 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  27.92 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  27.92 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  27.92 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  28.15 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  28.1 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  28.85 
 
 		 271 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2088  HAD superfamily hydrolase  31.95 
 
 		 269 aa  102  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.656055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  28.51 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  28.51 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  28.63 
 
 		 271 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  29.96 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  28.21 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  29.88 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  27.67 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  28.21 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  28.85 
 
 		 271 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  28.46 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  28.46 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  28.46 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  28.08 
 
 		 271 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  29.46 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  27.97 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  28.08 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0545  hydrolase  31.15 
 
 		 278 aa  95.5  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 		 272 aa  95.5  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  25 
 
 		 283 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.82 
 
 		 282 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  28.08 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  28.14 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0815  HAD superfamily hydrolase  30.8 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.493378  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  29.03 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  27.31 
 
 		 269 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  27.31 
 
 		 269 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  27.82 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  27.31 
 
 		 269 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  27.31 
 
 		 269 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1793  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.31 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2751  Cof-like hydrolase  26.05 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.181052  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  26.92 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  26.29 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  25.51 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1451  Cof-like hydrolase  29.17 
 
 		 276 aa  89.4  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  28.41 
 
 		 273 aa  89  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  29.6 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  29.46 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3962  HAD superfamily hydrolase  26.34 
 
 		 268 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3793  HAD superfamily hydrolase  26.34 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4271  HAD superfamily hydrolase  26.34 
 
 		 268 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.596112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4072  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.34 
 
 		 268 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0578925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1878  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  22.49 
 
 		 270 aa  86.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  28.74 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3808  HAD superfamily hydrolase  25.67 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0549007  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  27.48 
 
 		 280 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4161  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.29 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1559  HAD superfamily hydrolase  26.02 
 
 		 268 aa  85.5  8e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.847302  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  26.82 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4119  HAD superfamily hydrolase  25.67 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  27.48 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  27.48 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4183  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.95 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000631727  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  27.48 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  27.48 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1558  HAD superfamily hydrolase  27.99 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  29.96 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  28.74 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  25.95 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1077  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.9 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000777546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  24.81 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3881  Cof-like hydrolase  24.14 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0852167  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  27.67 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  31.2 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2762  Cof-like hydrolase  25.38 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  26.72 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  27.59 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  28 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  27.38 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>