More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06933 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  551  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  81.89 
 
 
267 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  50 
 
 
262 aa  261  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  49.62 
 
 
262 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  45.91 
 
 
279 aa  231  7.000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  42.59 
 
 
265 aa  224  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  43.08 
 
 
287 aa  208  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  38.46 
 
 
283 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.4 
 
 
282 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  40.22 
 
 
281 aa  189  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  36.19 
 
 
261 aa  186  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  36.26 
 
 
263 aa  163  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  32.69 
 
 
269 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  32.05 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  34.13 
 
 
256 aa  136  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  31.66 
 
 
271 aa  135  9e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  31.66 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  31.66 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  31.66 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  31.66 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  31.66 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  31.66 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  32.7 
 
 
270 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.136423 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  33.83 
 
 
271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  33.83 
 
 
271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  33.83 
 
 
271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  33.46 
 
 
271 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  30.74 
 
 
265 aa  132  7.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  31.66 
 
 
271 aa  131  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  33.46 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  33.46 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  33.46 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2548  Cof-like hydrolase  34.08 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0286905  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2600  Cof-like hydrolase  34.08 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.20198  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  31.68 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2405  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.73 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1793  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.73 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324577  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  29.89 
 
 
269 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  29.5 
 
 
269 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  29.5 
 
 
269 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  29.5 
 
 
269 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  29.5 
 
 
269 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  33.46 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  30.57 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  33.83 
 
 
271 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  32.34 
 
 
265 aa  119  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1878  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.68 
 
 
270 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  31.42 
 
 
271 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  31.42 
 
 
271 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  31.42 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2088  HAD superfamily hydrolase  32.59 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.656055  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  31.03 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  30.65 
 
 
271 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  29.57 
 
 
263 aa  111  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  32.42 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  33.83 
 
 
273 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  30.65 
 
 
262 aa  105  6e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  27.73 
 
 
262 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2751  Cof-like hydrolase  30.04 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.181052  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  27.1 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  27.41 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  29.96 
 
 
273 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  26.72 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  29.96 
 
 
273 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0545  hydrolase  28 
 
 
278 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  29.96 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  29.96 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  29.96 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  29.96 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  27.41 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  29.89 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  29.1 
 
 
266 aa  92.8  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  28.84 
 
 
291 aa  92.4  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1077  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.85 
 
 
268 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000777546  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4161  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.46 
 
 
268 aa  92  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4119  HAD superfamily hydrolase  28.06 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0836  HAD superfamily hydrolase  27.17 
 
 
273 aa  90.5  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.781364  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3808  HAD superfamily hydrolase  28.06 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0549007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3881  Cof-like hydrolase  28.06 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0852167  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  28.95 
 
 
274 aa  89.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  29.48 
 
 
273 aa  89  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 
274 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4183  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.06 
 
 
268 aa  89  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000631727  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  28.57 
 
 
274 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 
274 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3962  HAD superfamily hydrolase  27.67 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3793  HAD superfamily hydrolase  27.67 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4271  HAD superfamily hydrolase  27.67 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.596112  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  27.44 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  27.44 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4072  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.67 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0578925 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  26.14 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  26.14 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  26.14 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.14 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  28.94 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  26.41 
 
 
268 aa  87  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  27.46 
 
 
289 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  26.14 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  27.46 
 
 
289 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>