More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2088 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2088  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 269 aa  553  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.656055  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2600  Cof-like hydrolase  73.11 
 
 		 266 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.20198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2548  Cof-like hydrolase  73.11 
 
 		 266 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0286905  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  36.33 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  35.96 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  35.96 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  35.96 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  35.96 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  35.09 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  34.72 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  35.09 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  35.09 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  35.09 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  34.72 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  34.72 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  34.72 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  34.72 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  34.34 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  36.6 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  35.07 
 
 		 263 aa  155  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  36.23 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  36.23 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  36.23 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  36.23 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  36.23 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  36.23 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  34.47 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  34.09 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  35.85 
 
 		 271 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  35.85 
 
 		 271 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  35.85 
 
 		 271 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  35.85 
 
 		 271 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  35.85 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  36.23 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  36.23 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  32.45 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  32.96 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  33.05 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  33.45 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  29.28 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  32.22 
 
 		 262 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  30.26 
 
 		 265 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0836  HAD superfamily hydrolase  28.68 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.781364  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  32.59 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  32.22 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0545  hydrolase  30.29 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  30.4 
 
 		 279 aa  112  9e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  27.92 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  28.25 
 
 		 265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  29.23 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  32.84 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.36 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  31 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  31 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.96 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  31.95 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2405  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.52 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1558  HAD superfamily hydrolase  26.15 
 
 		 285 aa  95.9  6e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  28.14 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0908  sugar phosphatase SupH  31.9 
 
 		 176 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2070  HAD superfamily hydrolase  26.67 
 
 		 269 aa  92  8e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208936  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  26.09 
 
 		 263 aa  89.7  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  27.78 
 
 		 262 aa  85.5  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1878  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.09 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  25.73 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  27.41 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1559  HAD superfamily hydrolase  27.72 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.847302  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  27.87 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  24.9 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  24.9 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  25.82 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  24.9 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1793  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.22 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324577  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0815  HAD superfamily hydrolase  27.41 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.493378  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  27.46 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  24.9 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  24.48 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  24.9 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  26.02 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  25.41 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  25.41 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  25.41 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  25.41 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  25.41 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0971  HAD family hydrolase  26.49 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  25.61 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  26.37 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3808  HAD superfamily hydrolase  27.57 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0549007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3793  HAD superfamily hydrolase  27.57 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4119  HAD superfamily hydrolase  26.86 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3962  HAD superfamily hydrolase  27.16 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4271  HAD superfamily hydrolase  27.16 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.596112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4072  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.16 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0578925 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  26.74 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4183  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.86 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000631727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2751  Cof-like hydrolase  26.67 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.181052  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  26.12 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  24.63 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1077  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.75 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000777546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  27.05 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>