More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0545 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0545  hydrolase  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0836  HAD superfamily hydrolase  32.5 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.781364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2548  Cof-like hydrolase  30.69 
 
 		 266 aa  118  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0286905  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2600  Cof-like hydrolase  30.69 
 
 		 266 aa  118  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.20198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  29.03 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  30.47 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  30.71 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0815  HAD superfamily hydrolase  31.29 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.493378  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2088  HAD superfamily hydrolase  30.29 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.656055  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  26.98 
 
 		 270 aa  112  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  30.96 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  30.96 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  30.96 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  30.96 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  29.12 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  30.96 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  30.96 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1559  HAD superfamily hydrolase  28.1 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.847302  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  28.11 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  30.15 
 
 		 262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  30.6 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  29.54 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  29.54 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  29.54 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  30.6 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  30.14 
 
 		 271 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  29.54 
 
 		 271 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2070  HAD superfamily hydrolase  31.65 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208936  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  29.18 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  29.18 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  29.68 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  29.68 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  28.83 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  26.79 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  29.33 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  29.03 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  29.45 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  27.01 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  28.67 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  29.18 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  29.18 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  28 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  28.67 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  27.8 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  30.25 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2405  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.21 
 
 		 263 aa  95.5  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  31.15 
 
 		 256 aa  95.5  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  28.67 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  28.67 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  28.67 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  28.67 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  28.67 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  28 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1558  HAD superfamily hydrolase  29.59 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1878  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.8 
 
 		 270 aa  92  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  28.12 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  27.6 
 
 		 262 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  26.55 
 
 		 267 aa  89  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  27.92 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1793  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.16 
 
 		 269 aa  85.5  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324577  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.91 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.95 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0971  HAD family hydrolase  25.96 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  24.48 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  26.69 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  26.64 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0247  HAD superfamily hydrolase  25.37 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  26.64 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 		 268 aa  72  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  24.82 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  25.64 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  24.73 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2024  Cof-like hydrolase  26.04 
 
 		 281 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  25.45 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  26.79 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2525  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.68 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000564566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  26.39 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  23.96 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  23.86 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  23.96 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.96 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  23.83 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  25.42 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  26.02 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  25.61 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  21.3 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  25.42 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  24.5 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  23.61 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  26.92 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  26.57 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2460  HAD superfamily hydrolase  23.42 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00284871  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  25.08 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2702  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.44 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  22.57 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  26.6 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.41 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  26.58 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.3 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2261  HAD superfamily hydrolase  22.71 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.839309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>